More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0044 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  539  1e-152  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
258 aa  179  6e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 
264 aa  174  2e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 
264 aa  174  2e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  35.74 
 
 
264 aa  173  2e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.74 
 
 
264 aa  174  2e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.74 
 
 
264 aa  174  2e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 
264 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.36 
 
 
264 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.98 
 
 
264 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
264 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.6 
 
 
264 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
267 aa  162  5e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
264 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
262 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
339 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
246 aa  155  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
262 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
245 aa  153  3e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
249 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
272 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
261 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
277 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
257 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
261 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
330 aa  146  4e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
330 aa  145  4e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
351 aa  146  4e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
238 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
253 aa  145  7e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
270 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
266 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  3.83418e-10 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
247 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
267 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.09968e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
295 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
258 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
272 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
332 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
258 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.62 
 
 
301 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
279 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
257 aa  141  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
280 aa  141  1e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
264 aa  141  1e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
293 aa  141  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
258 aa  140  1e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
276 aa  140  2e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.24332e-12 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
286 aa  140  2e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
252 aa  140  2e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.29 
 
 
246 aa  140  2e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
275 aa  140  2e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
258 aa  140  2e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  30.97 
 
 
269 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
271 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
347 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
259 aa  139  4e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
253 aa  139  5e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
238 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
268 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  138  8e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  138  9e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59131e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  138  9e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.61938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
299 aa  138  9e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  138  9e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  8.94376e-15 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  138  9e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
317 aa  138  9e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
257 aa  138  9e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
332 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
268 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
266 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  36.61 
 
 
295 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
242 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
247 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
242 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
242 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
242 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
242 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
274 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
292 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
665 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
269 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
250 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 
344 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
260 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
269 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
261 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
245 aa  136  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
238 aa  136  3e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 
244 aa  136  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
254 aa  136  3e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
243 aa  136  3e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  36.45 
 
 
275 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
240 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
258 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.358068  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
247 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
244 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23251e-09 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
248 aa  135  6e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
253 aa  135  6e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>