253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1332 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  82.45 
 
 
622 aa  1007    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  100 
 
 
619 aa  1212    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  61.15 
 
 
611 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  53.76 
 
 
623 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  52.32 
 
 
623 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  52.24 
 
 
623 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  52.46 
 
 
626 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  37.89 
 
 
632 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  37.89 
 
 
632 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  37.14 
 
 
613 aa  347  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  36.78 
 
 
623 aa  347  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  37.64 
 
 
632 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  35.98 
 
 
623 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  35.78 
 
 
618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  35.78 
 
 
627 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  30.24 
 
 
599 aa  206  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  31.3 
 
 
588 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  29.13 
 
 
588 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.48 
 
 
727 aa  134  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.28 
 
 
587 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  30.65 
 
 
486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
631 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  32.15 
 
 
487 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 
548 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  29.69 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  31.44 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
485 aa  117  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.53 
 
 
477 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.24 
 
 
920 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 
847 aa  114  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  30.7 
 
 
657 aa  111  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  28.65 
 
 
640 aa  110  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
482 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  34.9 
 
 
585 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  31.9 
 
 
485 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
631 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 
554 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 
554 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  33.87 
 
 
1363 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 
554 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  33.2 
 
 
1363 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 
566 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  28.81 
 
 
838 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  27.49 
 
 
539 aa  103  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 
457 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.64 
 
 
818 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  30.47 
 
 
682 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 
480 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.97 
 
 
858 aa  102  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.97 
 
 
858 aa  101  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
465 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.74 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 
683 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 
688 aa  99.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 
484 aa  99.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 
487 aa  99.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28 
 
 
541 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 
457 aa  99  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  30.56 
 
 
537 aa  98.6  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.35 
 
 
457 aa  98.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  34.14 
 
 
680 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  24.24 
 
 
644 aa  98.2  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
583 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
456 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  26.89 
 
 
657 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 
657 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.92 
 
 
637 aa  97.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 
685 aa  97.4  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  29.09 
 
 
457 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  24.58 
 
 
531 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  26.21 
 
 
457 aa  97.4  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 
493 aa  96.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  29.14 
 
 
680 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  31.9 
 
 
660 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 
489 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.75 
 
 
623 aa  95.1  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 
546 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.87 
 
 
478 aa  94.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 
486 aa  93.6  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
714 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
638 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  22.83 
 
 
471 aa  93.6  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
667 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  31.08 
 
 
660 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
667 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.17 
 
 
696 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 
682 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 
667 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 
643 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 
643 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 
643 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  28.61 
 
 
547 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.99 
 
 
547 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>