More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5336 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
419 aa  832    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  74.19 
 
 
432 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  65.19 
 
 
403 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  61.31 
 
 
407 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  60.63 
 
 
406 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  55.95 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  56.19 
 
 
429 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  50.85 
 
 
414 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
409 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  51.58 
 
 
421 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  50.12 
 
 
406 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 
409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  53 
 
 
419 aa  345  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  49.26 
 
 
410 aa  346  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  51.71 
 
 
410 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  51.3 
 
 
380 aa  344  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  53.55 
 
 
419 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1853  phosphoserine phosphatase SerB  51.96 
 
 
417 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1900  phosphoserine phosphatase SerB  51.96 
 
 
417 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1834  phosphoserine phosphatase SerB  51.96 
 
 
417 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0739277  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  53.85 
 
 
306 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  53.85 
 
 
306 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  40.77 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  41.38 
 
 
406 aa  270  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  40.05 
 
 
405 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  40.74 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  39.36 
 
 
410 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  40.93 
 
 
418 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  40.25 
 
 
404 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  39.85 
 
 
404 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  40.25 
 
 
415 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  40.25 
 
 
404 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 
404 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  40.78 
 
 
418 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  40.9 
 
 
408 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  39.08 
 
 
412 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  37.53 
 
 
410 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.08 
 
 
404 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  41.16 
 
 
429 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  39.95 
 
 
398 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  37.47 
 
 
410 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  40.93 
 
 
411 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  39.22 
 
 
404 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  40.19 
 
 
429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  40.1 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  39.9 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  36.92 
 
 
438 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  40.4 
 
 
405 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  37.56 
 
 
413 aa  250  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  40.15 
 
 
405 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  40.15 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2123  phosphoserine phosphatase  50.18 
 
 
297 aa  242  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  53.62 
 
 
297 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  39.75 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  56.1 
 
 
223 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  49.11 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  51.2 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  51.2 
 
 
326 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  51.2 
 
 
326 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  47.28 
 
 
325 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  48.68 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1168  phosphoserine phosphatase SerB  50.25 
 
 
213 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.748705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  48.84 
 
 
299 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  49.56 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  48.91 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  52.02 
 
 
322 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1689  phosphoserine phosphatase SerB  55.1 
 
 
216 aa  196  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  48.95 
 
 
281 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  47.81 
 
 
325 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 
322 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  47.84 
 
 
279 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  51.52 
 
 
322 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  52.53 
 
 
322 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
307 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  52.53 
 
 
322 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  52.53 
 
 
322 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  52.53 
 
 
322 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  52.53 
 
 
322 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  50.22 
 
 
281 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  48.68 
 
 
325 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  49.51 
 
 
215 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 
279 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21750  phosphoserine phosphatase SerB  55.83 
 
 
234 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.875318  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
326 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  42.47 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.65 
 
 
435 aa  190  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  49.12 
 
 
279 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  47.83 
 
 
285 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  45.53 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  45.76 
 
 
357 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  51.74 
 
 
279 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.83 
 
 
285 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  50.23 
 
 
281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>