114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5275 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
698 aa  1349    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  76.62 
 
 
665 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  70.68 
 
 
899 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  66.31 
 
 
639 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  65.48 
 
 
330 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  56.09 
 
 
495 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  58.36 
 
 
343 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  58.8 
 
 
388 aa  346  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  58.8 
 
 
388 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  58.8 
 
 
388 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  57.77 
 
 
364 aa  336  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  56.29 
 
 
418 aa  335  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  55.37 
 
 
362 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  57.98 
 
 
346 aa  324  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  55.28 
 
 
478 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  55.67 
 
 
405 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  56.29 
 
 
771 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  55.17 
 
 
759 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  41.67 
 
 
455 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  40.33 
 
 
463 aa  210  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  38.14 
 
 
453 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  35.11 
 
 
416 aa  204  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  43.1 
 
 
412 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  39.6 
 
 
587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  40.21 
 
 
666 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  36.55 
 
 
475 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  35.35 
 
 
552 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  36.55 
 
 
475 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  36.55 
 
 
475 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  34.32 
 
 
414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  36.03 
 
 
425 aa  173  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  34.72 
 
 
1132 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  36.36 
 
 
926 aa  161  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  33.67 
 
 
811 aa  154  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  37.07 
 
 
968 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  34.42 
 
 
390 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  36.5 
 
 
1160 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  34.01 
 
 
1519 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  37.34 
 
 
319 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  37.34 
 
 
319 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  37.34 
 
 
319 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.4 
 
 
542 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  34.99 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  33.56 
 
 
586 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  35.76 
 
 
390 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.27 
 
 
532 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  32.94 
 
 
533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  36.04 
 
 
380 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  31.27 
 
 
617 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  30.07 
 
 
544 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  32.11 
 
 
439 aa  104  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  32.32 
 
 
474 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  33.46 
 
 
487 aa  102  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  29.01 
 
 
341 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.86 
 
 
334 aa  98.2  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  28.53 
 
 
579 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  29.31 
 
 
485 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  29.04 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  28.57 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  29.84 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.51 
 
 
288 aa  58.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  27.34 
 
 
544 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7293  hypothetical protein  26.35 
 
 
1095 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
367 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  31.58 
 
 
315 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.9 
 
 
470 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  31.18 
 
 
332 aa  50.4  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  28.64 
 
 
400 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 
278 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  37.23 
 
 
314 aa  50.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  35.67 
 
 
287 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
350 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
317 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  34.06 
 
 
290 aa  48.9  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.48 
 
 
269 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  36.81 
 
 
319 aa  48.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 
339 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.69 
 
 
398 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.56 
 
 
362 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  32.33 
 
 
327 aa  47  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
272 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  26.07 
 
 
370 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
306 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1726  hypothetical protein  25.47 
 
 
550 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0145734  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.38 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.03 
 
 
298 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  31.39 
 
 
268 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.47 
 
 
400 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  30.28 
 
 
397 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
322 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.56 
 
 
293 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.46 
 
 
322 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  31.46 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.82 
 
 
255 aa  45.4  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.16 
 
 
329 aa  44.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 
397 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.15 
 
 
316 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 
287 aa  44.7  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.17 
 
 
330 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.43 
 
 
330 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>