More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3802 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  56.9 
 
 		 710 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  54.61 
 
 		 717 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  50.4 
 
 		 770 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  54.2 
 
 		 722 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  55.71 
 
 		 729 aa  786    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  56.76 
 
 		 714 aa  766    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  53.99 
 
 		 717 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  54.63 
 
 		 722 aa  698    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  55.68 
 
 		 696 aa  657    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  56.47 
 
 		 719 aa  775    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  55.63 
 
 		 708 aa  776    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  55.8 
 
 		 713 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  55.8 
 
 		 713 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  54.75 
 
 		 674 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  53.67 
 
 		 726 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  56.66 
 
 		 719 aa  800    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  52.45 
 
 		 718 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  56.09 
 
 		 701 aa  748    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  100 
 
 		 729 aa  1442    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  55.8 
 
 		 713 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  55.56 
 
 		 741 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  36.18 
 
 		 695 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  35.29 
 
 		 679 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.4 
 
 		 683 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  35.24 
 
 		 667 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  33.24 
 
 		 696 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.91 
 
 		 692 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.37 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.03 
 
 		 695 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.84 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  38.57 
 
 		 687 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.57 
 
 		 683 aa  389  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  33.01 
 
 		 694 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.01 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  33.57 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  34.81 
 
 		 680 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  31.84 
 
 		 696 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  34.16 
 
 		 691 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  34.49 
 
 		 693 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  35.89 
 
 		 690 aa  382  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.1 
 
 		 673 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  31.75 
 
 		 696 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  33.19 
 
 		 698 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 696 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.31 
 
 		 687 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.79 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  31.43 
 
 		 697 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  32.82 
 
 		 694 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  32.73 
 
 		 697 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.6 
 
 		 694 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  34.12 
 
 		 690 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  34.41 
 
 		 681 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.32 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  32.77 
 
 		 693 aa  365  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.74 
 
 		 682 aa  365  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.65 
 
 		 686 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  32.13 
 
 		 690 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  31.73 
 
 		 682 aa  363  6e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  32.46 
 
 		 701 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  31.67 
 
 		 697 aa  363  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  34.65 
 
 		 677 aa  360  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  32.69 
 
 		 697 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.98 
 
 		 689 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  33.89 
 
 		 701 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.98 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  32.03 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.6 
 
 		 697 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  32.68 
 
 		 695 aa  357  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  37.38 
 
 		 700 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  34.07 
 
 		 688 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  33.93 
 
 		 685 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  32.14 
 
 		 686 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  31.93 
 
 		 699 aa  355  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000439347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  32.82 
 
 		 692 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  31.14 
 
 		 694 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  33.89 
 
 		 703 aa  353  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  31.33 
 
 		 702 aa  353  8e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 689 aa  352  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  30.74 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  32.68 
 
 		 692 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  32.4 
 
 		 703 aa  351  3e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  32.36 
 
 		 693 aa  351  3e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  30.25 
 
 		 693 aa  350  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  30.87 
 
 		 693 aa  350  6e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.77 
 
 		 692 aa  350  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  32.83 
 
 		 701 aa  350  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  32.93 
 
 		 707 aa  349  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  31.28 
 
 		 693 aa  349  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  31.28 
 
 		 693 aa  349  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  34.62 
 
 		 701 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  32.21 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  32.3 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  32.21 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  32.21 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  32.21 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  31.84 
 
 		 700 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  32.16 
 
 		 692 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  33.24 
 
 		 707 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  32.27 
 
 		 700 aa  348  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  32.4 
 
 		 691 aa  348  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>