More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1806 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  100 
 
 		 393 aa  774    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  59.36 
 
 		 373 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  50.52 
 
 		 347 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  48.29 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  42.53 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  44.3 
 
 		 294 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  43.4 
 
 		 293 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 293 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  43.4 
 
 		 293 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  46.21 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  47.62 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  42.21 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  41.36 
 
 		 295 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 293 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  43.05 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  43.05 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  43.05 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  44.33 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  40.89 
 
 		 293 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  40.86 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  40.47 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  40.86 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  40.13 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  40.13 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  40.6 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  40.48 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.51 
 
 		 299 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  43.39 
 
 		 302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  40.78 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  43.94 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  44.68 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  43.6 
 
 		 294 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  43.6 
 
 		 294 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.49 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  40.21 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  42.51 
 
 		 298 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 		 298 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  42.05 
 
 		 298 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 		 298 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.68 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  39.93 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  41.87 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  39.18 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.77 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  39.47 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.02 
 
 		 293 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  39.12 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  43.62 
 
 		 301 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  38.25 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  37.46 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  40.77 
 
 		 277 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 		 297 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  44.25 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 		 288 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  38.36 
 
 		 287 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  41.69 
 
 		 296 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  38.98 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  39.58 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  43.79 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  38.52 
 
 		 292 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  39.66 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  38.36 
 
 		 282 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  43.16 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  42.73 
 
 		 229 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  39.3 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  36.11 
 
 		 301 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  40.07 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 289 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1402  UspA domain-containing protein  38.8 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  38.83 
 
 		 321 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  38.31 
 
 		 300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  38.33 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2049  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  36.75 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  34.28 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  40.77 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  36.04 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  32.65 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.67 
 
 		 294 aa  119  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.83 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.62 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  42.08 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  35.03 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  40.69 
 
 		 286 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2076  UspA domain protein  37.07 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000523468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.52 
 
 		 305 aa  117  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.15 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  36.68 
 
 		 288 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  40.96 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.89 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>