More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5586 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 
305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  88.82 
 
 
305 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.15 
 
 
319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.12 
 
 
312 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.24 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  36.24 
 
 
314 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.94 
 
 
313 aa  176  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  37.25 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7295  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.67 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39 
 
 
323 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  36.04 
 
 
316 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  37.38 
 
 
321 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  35 
 
 
324 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.16 
 
 
324 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.2 
 
 
324 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.69 
 
 
324 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.41 
 
 
315 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.87 
 
 
328 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.09 
 
 
328 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.53 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  37 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.09 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.96 
 
 
325 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.55 
 
 
330 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.55 
 
 
313 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  35.94 
 
 
321 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.09 
 
 
331 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.44 
 
 
329 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.78 
 
 
332 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.37 
 
 
328 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 
323 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.95 
 
 
338 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.13 
 
 
325 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.27 
 
 
332 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.27 
 
 
332 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.27 
 
 
316 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.27 
 
 
332 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.75 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.33 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.57 
 
 
342 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.4 
 
 
324 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.48 
 
 
332 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2390  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.7 
 
 
314 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0521943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  36.98 
 
 
314 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.69 
 
 
324 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  32.43 
 
 
317 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.02 
 
 
334 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.89 
 
 
328 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.91 
 
 
330 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259631  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.42 
 
 
323 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.21 
 
 
317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.44 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.42 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  35.74 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.78 
 
 
323 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.85 
 
 
325 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3844  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.56 
 
 
315 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.03 
 
 
319 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.79 
 
 
316 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.14 
 
 
309 aa  142  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3599  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.23 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.82 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.6 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.9 
 
 
316 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.14 
 
 
313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.16 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.16 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3073  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.73 
 
 
327 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 
331 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4359  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.18 
 
 
328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.36 
 
 
313 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  33.11 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51080  putative dioxygenase  34.38 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000609604 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.73 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.36 
 
 
326 aa  132  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397206  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1248  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.75 
 
 
326 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.955135  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4138  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.34 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10270  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.66 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0212117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1526  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.78 
 
 
355 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4180  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.89 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.24 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2356  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.71 
 
 
386 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1855  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.9 
 
 
327 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1729  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.03 
 
 
326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1612  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.41 
 
 
326 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1182  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.56 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1665  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.1 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2062  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.66 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.25 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.76 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5269  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.8 
 
 
356 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04180  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.23 
 
 
316 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.63979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03920  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  34.45 
 
 
316 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.62232  normal  0.810492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1487  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.8 
 
 
356 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.72 
 
 
380 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4772  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.62 
 
 
356 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5071  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.62 
 
 
356 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615847  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4686  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.62 
 
 
356 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.89 
 
 
360 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2607  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.77 
 
 
353 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>