78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2961 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  88.4 
 
 
250 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  71.2 
 
 
259 aa  347  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  65.46 
 
 
256 aa  341  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  63.86 
 
 
256 aa  314  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  45.97 
 
 
408 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  47.18 
 
 
412 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  46.94 
 
 
397 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  42.4 
 
 
251 aa  211  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  46.77 
 
 
405 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  39.76 
 
 
405 aa  208  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  44.35 
 
 
409 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  41.6 
 
 
402 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  44.94 
 
 
406 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  41.3 
 
 
413 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  44.76 
 
 
407 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  44.76 
 
 
406 aa  198  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  44.76 
 
 
410 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  44.35 
 
 
423 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  45.97 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  42.74 
 
 
405 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  42.74 
 
 
406 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  42.23 
 
 
257 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  43.03 
 
 
257 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  40.4 
 
 
415 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  45.75 
 
 
409 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  45.16 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  49 
 
 
418 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  42.8 
 
 
410 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  42 
 
 
410 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  43.15 
 
 
407 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  48.93 
 
 
408 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  48.68 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  48.5 
 
 
408 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  37.85 
 
 
258 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
256 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  33.6 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  35.32 
 
 
411 aa  111  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  39.46 
 
 
145 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.8 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.61 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.95 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  26.41 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  26.54 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.1 
 
 
364 aa  62  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.49 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  28.5 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  25.75 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  23.97 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  24.83 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  30.39 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  29.38 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  35.54 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  25.53 
 
 
348 aa  49.3  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  26.69 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  26.14 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  26.14 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  29.72 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  24.06 
 
 
306 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.37 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  34.31 
 
 
467 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  21.3 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  21.3 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  21.3 
 
 
292 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  24.75 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  23.01 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  24.58 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  21.3 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  25.32 
 
 
292 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.18 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  24.07 
 
 
615 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  31.68 
 
 
290 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>