290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2916 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  70.89 
 
 		 484 aa  641    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  70.89 
 
 		 484 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  100 
 
 		 484 aa  967    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  70.69 
 
 		 484 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  36.81 
 
 		 488 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.11 
 
 		 491 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.91 
 
 		 491 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.03 
 
 		 488 aa  310  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.79 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  34.63 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.25 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.13 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.2 
 
 		 486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  33.26 
 
 		 499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.86 
 
 		 493 aa  289  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.86 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.61 
 
 		 509 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.34 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  31.4 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  31.2 
 
 		 493 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.44 
 
 		 490 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  31.2 
 
 		 490 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.61 
 
 		 490 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  31.4 
 
 		 490 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  31.2 
 
 		 493 aa  276  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  31.2 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  31.2 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  31.2 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  31.4 
 
 		 536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.61 
 
 		 490 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.18 
 
 		 508 aa  266  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.95 
 
 		 500 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.21 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.84 
 
 		 509 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  35.04 
 
 		 489 aa  263  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  30.53 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  31.42 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.04 
 
 		 474 aa  259  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  29.94 
 
 		 542 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  29.62 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.32 
 
 		 495 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.61 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.57 
 
 		 501 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.17 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.78 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.66 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.45 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.76 
 
 		 486 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.84 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.5 
 
 		 473 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.67 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  29.67 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  30.08 
 
 		 473 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.61 
 
 		 473 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  29.67 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  29.46 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  29.46 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  29.5 
 
 		 473 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  29.96 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.52 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.64 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  29.58 
 
 		 483 aa  210  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  35.41 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  36.16 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.35 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.9 
 
 		 472 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.77 
 
 		 479 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  28.85 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.91 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.59 
 
 		 472 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.38 
 
 		 476 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  25.38 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.41 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  24.89 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.15 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  30.89 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0179  lysine decarboxylase, constitutive  26.3 
 
 		 713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0651  lysine decarboxylase  25.35 
 
 		 755 aa  137  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1204  Lysine decarboxylase  24.49 
 
 		 755 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000345453  normal  0.552697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  25.32 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  24.68 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00184  lysine decarboxylase 2, constitutive  26.12 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0188  lysine decarboxylase, constitutive  26.12 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3417  Lysine decarboxylase  26.12 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00183  hypothetical protein  26.12 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0196  lysine decarboxylase, constitutive  26.12 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3474  lysine decarboxylase  26.12 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0197  lysine decarboxylase, constitutive  25.94 
 
 		 713 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.35 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0190  lysine decarboxylase, constitutive  25.94 
 
 		 713 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  24.94 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3767  lysine decarboxylase  24.73 
 
 		 713 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00012661  normal  0.0717066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5647  lysine decarboxylase, constitutive  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04002  lysine decarboxylase 1  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.82832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4686  lysine decarboxylase homolog, constitutive  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3860  Lysine decarboxylase  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4372  lysine decarboxylase, constitutive  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.152714  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4600  lysine decarboxylase, constitutive  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.416329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3896  lysine decarboxylase  25.09 
 
 		 715 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.65 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>