More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0982 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  79.56 
 
 		 274 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  79.56 
 
 		 274 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  79.56 
 
 		 274 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  67.53 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.22 
 
 		 274 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.72 
 
 		 275 aa  299  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  56.63 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.36 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.35 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  52.52 
 
 		 282 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  49.07 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 		 279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.01 
 
 		 273 aa  244  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 		 280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  45.79 
 
 		 280 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 		 276 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2331  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 		 305 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.7 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 287 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  41.35 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 		 276 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 279 aa  194  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  41.91 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.81 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 279 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  40.3 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  38.69 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 		 283 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.33 
 
 		 287 aa  181  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>