More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0007 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00110  DNA gyrase subunit A  57.93 
 
 		 943 aa  814    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0006  DNA gyrase subunit A  60.45 
 
 		 871 aa  848    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.307841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0009  DNA gyrase subunit A  71.78 
 
 		 839 aa  1010    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.224666  normal  0.174367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1431  DNA gyrase subunit A  58.58 
 
 		 883 aa  837    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00070  DNA gyrase subunit A  62.22 
 
 		 883 aa  868    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0006  DNA gyrase, A subunit  47.15 
 
 		 820 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0007  DNA gyrase, A subunit  64.69 
 
 		 839 aa  926    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0010  DNA gyrase, A subunit  83.94 
 
 		 837 aa  1207    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0007  DNA gyrase subunit A  62.21 
 
 		 885 aa  860    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.743623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  64.06 
 
 		 848 aa  924    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00060  DNA gyrase subunit A  47.89 
 
 		 870 aa  648    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00061935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00070  DNA gyrase subunit A  61.27 
 
 		 875 aa  861    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0008  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.04 
 
 		 836 aa  939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2361  DNA gyrase subunit A  47.62 
 
 		 827 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00518277  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0040  DNA gyrase, A subunit  58.89 
 
 		 876 aa  853    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0007  DNA gyrase subunit A  63.34 
 
 		 876 aa  882    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000011369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0007  DNA gyrase, A subunit  61.59 
 
 		 856 aa  845    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4627  DNA gyrase, A subunit  47.12 
 
 		 827 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0007  DNA gyrase A subunit  69.91 
 
 		 831 aa  990    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.386887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0007  DNA gyrase, A subunit  61.89 
 
 		 870 aa  856    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  65.82 
 
 		 834 aa  938    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0011  DNA gyrase, A subunit  70.95 
 
 		 822 aa  962    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.81481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0008  DNA gyrase subunit A  75.32 
 
 		 831 aa  1055    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00060  DNA gyrase subunit A  59.39 
 
 		 898 aa  822    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  46.51 
 
 		 830 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0007  DNA gyrase, A subunit  49.06 
 
 		 811 aa  648    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0007  DNA gyrase subunit A  94.33 
 
 		 836 aa  1345    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0674911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0006  DNA gyrase, A subunit  82.23 
 
 		 827 aa  1153    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  88.46 
 
 		 1257 aa  2291    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0007  DNA gyrase subunit A  66.71 
 
 		 837 aa  936    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.822047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00070  DNA gyrase subunit A  73.03 
 
 		 841 aa  1062    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0318292  normal  0.41561 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0007  DNA gyrase, A subunit  47.02 
 
 		 818 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000039295  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0007  DNA gyrase, A subunit  48.05 
 
 		 901 aa  641    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.607285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0007  DNA gyrase subunit A  75.69 
 
 		 840 aa  1068    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10006  DNA gyrase subunit A  90.1 
 
 		 838 aa  1275    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0007  DNA gyrase, A subunit  65.5 
 
 		 870 aa  907    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0197472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0007  DNA gyrase subunit A  63.46 
 
 		 902 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0007  DNA gyrase subunit A  64.5 
 
 		 834 aa  924    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0008  DNA gyrase subunit A  71.63 
 
 		 839 aa  1008    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0006  DNA gyrase subunit A  68.4 
 
 		 834 aa  956    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0007  DNA gyrase subunit A  59.46 
 
 		 922 aa  853    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  88.46 
 
 		 1257 aa  2291    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0007  DNA gyrase subunit A  65.95 
 
 		 875 aa  927    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876673  normal  0.542792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  100 
 
 		 1262 aa  2571    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0821  DNA gyrase, A subunit  92.78 
 
 		 1261 aa  2382    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308334  normal  0.183693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0007  DNA gyrase subunit A  62.77 
 
 		 910 aa  862    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  46.7 
 
 		 839 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  46.7 
 
 		 839 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0006  DNA gyrase subunit A  47.73 
 
 		 825 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.119691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0006  DNA gyrase subunit A  46.73 
 
 		 821 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0979169  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5314  DNA gyrase subunit A  46.88 
 
 		 823 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0584522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0006  DNA gyrase subunit A  47.17 
 
 		 823 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  47.02 
 
 		 823 aa  628  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0006  DNA gyrase, A subunit  48.48 
 
 		 883 aa  628  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  47.02 
 
 		 823 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  47.02 
 
 		 823 aa  628  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  46.88 
 
 		 823 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0006  DNA gyrase subunit A  47.02 
 
 		 823 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1067  DNA gyrase, A subunit  47.53 
 
 		 809 aa  629  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0005  DNA gyrase, A subunit  46.19 
 
 		 836 aa  629  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  47.02 
 
 		 823 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0005  DNA gyrase, A subunit  46.04 
 
 		 836 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0006  DNA gyrase subunit A  46.73 
 
 		 823 aa  626  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.182786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  46.51 
 
 		 814 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0006  DNA gyrase, A subunit  45.25 
 
 		 899 aa  625  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0103  DNA gyrase, A subunit  45.9 
 
 		 828 aa  625  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000929696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0006  DNA gyrase subunit A  46.59 
 
 		 823 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0500902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0295  DNA gyrase, A subunit  44.46 
 
 		 815 aa  620  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000104169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0010  DNA gyrase, A subunit  45.35 
 
 		 807 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0200618  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  46.53 
 
 		 852 aa  622  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0006  DNA gyrase subunit A  47.58 
 
 		 818 aa  622  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2663  DNA gyrase subunit A  45.3 
 
 		 827 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0795874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2331  DNA gyrase, A subunit  46.67 
 
 		 824 aa  619  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.772308  hitchhiker  0.00342265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  46.44 
 
 		 949 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0007  DNA gyrase, A subunit  46.58 
 
 		 932 aa  619  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0706522  hitchhiker  0.000130108 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  45.43 
 
 		 828 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1535  DNA gyrase, A subunit  44.83 
 
 		 864 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0729  DNA gyrase, A subunit  47.39 
 
 		 823 aa  612  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  45 
 
 		 857 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3482  DNA gyrase, A subunit  45.6 
 
 		 840 aa  609  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  42.8 
 
 		 864 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0008  DNA gyrase subunit A  43.9 
 
 		 807 aa  608  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.425562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0125  DNA gyrase, A subunit  44.71 
 
 		 828 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000507659  decreased coverage  0.00116524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0008  DNA gyrase, A subunit  46.52 
 
 		 809 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.191063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0005  DNA gyrase, A subunit  44.96 
 
 		 832 aa  606  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00060  DNA gyrase subunit A  44.32 
 
 		 838 aa  604  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0137  DNA gyrase, A subunit  44.46 
 
 		 826 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  43.4 
 
 		 849 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  43.87 
 
 		 893 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0006  DNA gyrase, A subunit  45.59 
 
 		 802 aa  606  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.540811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  45.56 
 
 		 813 aa  605  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0005  DNA gyrase, A subunit  45.61 
 
 		 843 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000262861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  44.04 
 
 		 893 aa  602  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  45.07 
 
 		 815 aa  601  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  44.5 
 
 		 857 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0006  DNA gyrase, A subunit  44.51 
 
 		 889 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0673  DNA gyrase, A subunit  44.94 
 
 		 830 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000124756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  42.76 
 
 		 829 aa  601  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0006  DNA gyrase, A subunit  44.51 
 
 		 889 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1408  DNA gyrase, A subunit  47.89 
 
 		 811 aa  599  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>