180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3533 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  100 
 
 
520 aa  1030  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  38.23 
 
 
514 aa  287  3e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  37.53 
 
 
511 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  36.44 
 
 
511 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.75 
 
 
513 aa  202  1e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  35.44 
 
 
512 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  34.68 
 
 
505 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  35.23 
 
 
512 aa  193  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  34.8 
 
 
512 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  35.39 
 
 
510 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.54 
 
 
490 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  33.26 
 
 
494 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.17 
 
 
487 aa  156  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  31.33 
 
 
510 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.33 
 
 
519 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  32.22 
 
 
508 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.39 
 
 
508 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.79 
 
 
596 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.91 
 
 
504 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  32.48 
 
 
508 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.47 
 
 
543 aa  133  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.27 
 
 
519 aa  130  5e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  32.7 
 
 
509 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  32.44 
 
 
508 aa  120  5e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  28.32 
 
 
499 aa  118  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.72 
 
 
494 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  35.29 
 
 
512 aa  115  2e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.95 
 
 
505 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  29.17 
 
 
539 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.24 
 
 
540 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  33.94 
 
 
498 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  30.04 
 
 
315 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  33.49 
 
 
286 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  38.66 
 
 
219 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  27.56 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  38.89 
 
 
213 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  27.56 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  25.97 
 
 
518 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  38.43 
 
 
213 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  38.43 
 
 
213 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  38.43 
 
 
213 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  38.43 
 
 
213 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  39.53 
 
 
215 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  39.53 
 
 
215 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  31.64 
 
 
310 aa  86.7  1e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  40.19 
 
 
206 aa  85.9  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  26.01 
 
 
510 aa  85.1  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  27.03 
 
 
505 aa  85.1  3e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  25.7 
 
 
529 aa  84.7  3e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  37.56 
 
 
219 aa  84.3  5e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  27.32 
 
 
498 aa  84.3  5e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  26.4 
 
 
508 aa  84.3  5e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  26.4 
 
 
508 aa  84  7e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  33.49 
 
 
495 aa  83.6  8e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  33.8 
 
 
318 aa  83.2  1e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  29.14 
 
 
500 aa  82.8  1e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  1.93925e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  26.13 
 
 
508 aa  82  2e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  29.84 
 
 
313 aa  82.4  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.52 
 
 
540 aa  81.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.52 
 
 
540 aa  81.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.52 
 
 
540 aa  81.6  3e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.67 
 
 
545 aa  82  3e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  30.72 
 
 
503 aa  80.9  5e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  34.42 
 
 
508 aa  80.5  6e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  35.71 
 
 
211 aa  79.7  1e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  32.69 
 
 
543 aa  79.7  1e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  35.45 
 
 
208 aa  79  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  33.17 
 
 
545 aa  78.6  2e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  31.44 
 
 
511 aa  78.6  2e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2886  hypothetical protein  35.62 
 
 
223 aa  79.3  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  34.78 
 
 
208 aa  79  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.29 
 
 
521 aa  79  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  36.61 
 
 
207 aa  78.6  3e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  25.79 
 
 
502 aa  78.2  3e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  27.92 
 
 
505 aa  78.2  3e-13  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  33.79 
 
 
512 aa  78.2  3e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  37.61 
 
 
213 aa  77.8  5e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  29.74 
 
 
503 aa  77  7e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  27.33 
 
 
518 aa  77  8e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  33.79 
 
 
512 aa  76.6  9e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  31.65 
 
 
500 aa  75.9  2e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  5.03049e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  31.63 
 
 
503 aa  75.1  3e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  32.86 
 
 
503 aa  75.1  3e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  31.16 
 
 
494 aa  74.7  4e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.69 
 
 
588 aa  74.3  4e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 
304 aa  72.8  1e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  30.04 
 
 
329 aa  72.8  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  23.85 
 
 
501 aa  72.4  2e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.05 
 
 
518 aa  72  2e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  32.04 
 
 
328 aa  72.4  2e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.29 
 
 
640 aa  72  3e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  35.81 
 
 
208 aa  71.6  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.29 
 
 
640 aa  72  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.29 
 
 
640 aa  72  3e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  35.81 
 
 
208 aa  71.6  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.29 
 
 
688 aa  71.2  4e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  30.88 
 
 
327 aa  70.5  8e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.29 
 
 
691 aa  69.7  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  31.8 
 
 
495 aa  69.3  1e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.95 
 
 
721 aa  68.6  2e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>