More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3210 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  100 
 
 		 342 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  77.78 
 
 		 341 aa  534  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  78.07 
 
 		 341 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  76.68 
 
 		 342 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  70.59 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  69.59 
 
 		 343 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 349 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  70.78 
 
 		 340 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  68.13 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  69.48 
 
 		 344 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  68.71 
 
 		 344 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  68.9 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  68.9 
 
 		 344 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  67.64 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  67.74 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  68.04 
 
 		 344 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 345 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  66.86 
 
 		 344 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  68.99 
 
 		 343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  70.09 
 
 		 345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 345 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  68.58 
 
 		 344 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  61.52 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  67.37 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  67.98 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  66.16 
 
 		 342 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  65.86 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  65.86 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  62.03 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  61.88 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  59.53 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  54.3 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  52.82 
 
 		 349 aa  359  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  53.85 
 
 		 352 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  49.7 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  47.08 
 
 		 352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  47.27 
 
 		 359 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  47.04 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  47.77 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 349 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  45.1 
 
 		 351 aa  308  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  43.79 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  45.88 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.62 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.32 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  43.2 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  44.51 
 
 		 370 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  43.93 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  43.67 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  44.8 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  44.41 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  44.41 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  43.54 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 338 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  42.39 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  42.81 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  44.74 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  43.71 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  42.03 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  41.92 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 345 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.64 
 
 		 325 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  40.83 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  42.43 
 
 		 343 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  40.86 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  42.06 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.95 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.34 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.37 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.04 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 313 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 313 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.29 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.58 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.34 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.48 
 
 		 343 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  41.01 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.99 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.94 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  39.6 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  39.57 
 
 		 329 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>