246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0034 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  100 
 
 
292 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  63.79 
 
 
328 aa  339  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  45.21 
 
 
301 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  44.88 
 
 
301 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  42.9 
 
 
302 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  43.89 
 
 
302 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  44.55 
 
 
302 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  43.89 
 
 
302 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  43.75 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  41.31 
 
 
303 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  40.19 
 
 
320 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  39.56 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  38.63 
 
 
320 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  39.56 
 
 
321 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  40.68 
 
 
320 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  42.26 
 
 
311 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  37.07 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  41.8 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  41.87 
 
 
327 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  41.61 
 
 
289 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  42.24 
 
 
293 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  41.95 
 
 
282 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  33.67 
 
 
320 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  32.92 
 
 
321 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  36.39 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  31.63 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  32.32 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  31.61 
 
 
281 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  32.12 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  44.09 
 
 
395 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  43.78 
 
 
395 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  36.51 
 
 
281 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  36.51 
 
 
281 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  30.9 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  43.55 
 
 
395 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
277 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  34.98 
 
 
284 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  31.31 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  39.89 
 
 
461 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  35.8 
 
 
461 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 
494 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  41.34 
 
 
592 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  31.31 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  46.27 
 
 
590 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  36.95 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.01 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  31.63 
 
 
332 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  32.99 
 
 
279 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  31.19 
 
 
319 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  41.21 
 
 
585 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  29.05 
 
 
282 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  45.45 
 
 
389 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  30 
 
 
275 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  43.75 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  27.46 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  27.39 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  30.38 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  37.42 
 
 
516 aa  92.4  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  30.03 
 
 
273 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  32.14 
 
 
380 aa  92  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  33.51 
 
 
389 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  33.33 
 
 
364 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  29.08 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  34.64 
 
 
522 aa  79  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  31.67 
 
 
582 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  25.58 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  25.58 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  38.1 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  26 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  25.67 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  25.67 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  25.5 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  24.58 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  28.9 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  27.03 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  27.8 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  24.75 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  24.91 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  30.13 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  27.8 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  26.97 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  33.58 
 
 
383 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  27.8 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  26.94 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  25.91 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  26.78 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  24.83 
 
 
263 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  32.37 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  24.09 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  26.45 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  24.74 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  35.56 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  27.49 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  31.06 
 
 
404 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  26.6 
 
 
298 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  30.15 
 
 
780 aa  57  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  25.17 
 
 
271 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  25.68 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  29.7 
 
 
513 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>