62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1051 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1051  ATPase  100 
 
 		 431 aa  870    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  60 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  47.5 
 
 		 439 aa  315  7e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  47.27 
 
 		 439 aa  300  5e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  38.16 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  38.62 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  37.16 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  37.85 
 
 		 458 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  35.27 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  36.17 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  35.86 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  36.59 
 
 		 461 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  34.56 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  32.94 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  32.97 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  33.56 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  34.51 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  37.16 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  32.32 
 
 		 464 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  32.43 
 
 		 454 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  36.09 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  34.55 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  31.63 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  32.96 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  31.97 
 
 		 470 aa  192  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  32.48 
 
 		 473 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  32.66 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  30.92 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  30.68 
 
 		 462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  31.11 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  30.52 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  31.45 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  30.13 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  29.11 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  27.98 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  29.05 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  28.6 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  27.89 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  26.52 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  27.95 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  25.59 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.38 
 
 		 475 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  26.9 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  25.32 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  26.52 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  25.76 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  23.43 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  24.03 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  24.8 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  30.19 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  31.25 
 
 		 283 aa  67  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0500  ATPase  27.17 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  26.36 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0397  ATPase  32.88 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0883  hypothetical protein  25.87 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0813  hypothetical protein  24.48 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.287694  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1219  hypothetical protein  24.48 
 
 		 273 aa  53.9  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2114  DUF234 DEXX-box ATPase  26.06 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0136  hypothetical protein  24.02 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1130  ATPase  26.33 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1267  ATPase  28.48 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1105  hypothetical protein  32.82 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.42011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>