More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2046 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
266 aa  521  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  86.04 
 
 
266 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  49.41 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
267 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
264 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  54.86 
 
 
266 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  54.33 
 
 
264 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
273 aa  235  6e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  47.43 
 
 
267 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 
436 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.27 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
270 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
264 aa  229  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
262 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
276 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
276 aa  228  7e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
264 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.03 
 
 
267 aa  226  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  54.69 
 
 
266 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
268 aa  224  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  50.39 
 
 
264 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  46.3 
 
 
265 aa  222  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
270 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  221  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
270 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
270 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
270 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.71 
 
 
270 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  49.23 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  53.91 
 
 
267 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
273 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  48.62 
 
 
271 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
283 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
270 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  48.15 
 
 
494 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0639  phosphomethylpyrimidine kinase  45.11 
 
 
290 aa  215  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.784703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  48.84 
 
 
266 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
490 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
266 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
277 aa  210  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 
270 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  54.05 
 
 
479 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
267 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
285 aa  209  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  47.86 
 
 
275 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  42.59 
 
 
272 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
268 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
268 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
268 aa  208  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 
267 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  50.83 
 
 
282 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0867  phosphomethylpyrimidine kinase  52.34 
 
 
264 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 
279 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  45.15 
 
 
450 aa  207  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 
449 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
288 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
262 aa  206  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
268 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
285 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  47.52 
 
 
269 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 
260 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
270 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 
267 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  51.16 
 
 
497 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50.97 
 
 
269 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
266 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3927  pyridoxal kinase  45.63 
 
 
273 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
288 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 
288 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5266  pyridoxal kinase  45.25 
 
 
274 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5093  pyridoxal kinase  45.25 
 
 
274 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5110  pyridoxal kinase  45.25 
 
 
274 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5663  pyridoxal kinase  45.25 
 
 
274 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5508  pyridoxal kinase  45.25 
 
 
274 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3739  phosphomethylpyrimidine kinase  47.45 
 
 
280 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5022  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
271 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1881  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
444 aa  202  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000178657  normal  0.46671 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
270 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
274 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1830  phosphomethylpyrimidine kinase  51.75 
 
 
261 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  42.69 
 
 
270 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  47.08 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
266 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5537  pyridoxal kinase  45.25 
 
 
274 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>