More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4543 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 250 aa  487  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  74.69 
 
 		 248 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  76.21 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  75.81 
 
 		 248 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  74 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  71.95 
 
 		 245 aa  344  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  60.5 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  59.24 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  58.82 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  59.24 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  60.83 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  58.05 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  57.14 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  57.14 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  57.33 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  54.01 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  56.96 
 
 		 241 aa  251  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  55.65 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  52.97 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  53.23 
 
 		 243 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  55.88 
 
 		 239 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  55.7 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  54.66 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  53.85 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  55.84 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  50.64 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  47.3 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  48.33 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  48.91 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  48.28 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  48.77 
 
 		 252 aa  198  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  48.71 
 
 		 227 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  47.35 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  44.1 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  45.65 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  44.78 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  42.61 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  38.72 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  42.8 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.44 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.44 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  39.24 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  39.66 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  38.72 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  40.69 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  39.32 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  40.26 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  39.51 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  39.51 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  39.65 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  38.66 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  38.89 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  36.17 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  36.78 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  39.59 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  39.42 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  38.66 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  38.4 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  38.93 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  36.25 
 
 		 226 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  36.63 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  34.57 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  35.6 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  38.14 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  35.77 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  35.77 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  36.86 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  35.06 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  37.1 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  35.15 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.4 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  34.27 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  37.14 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  35.29 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  30.34 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  31.54 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  35.53 
 
 		 319 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  35.15 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  30.64 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  34.3 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  35.53 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  35.91 
 
 		 210 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  34.52 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  35.71 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  34.57 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>