More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4774 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  46.39 
 
 
400 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 
399 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  46.97 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  47.99 
 
 
404 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.64 
 
 
394 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
429 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
429 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  47.85 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  46.7 
 
 
399 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  46.61 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  46.61 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  46.61 
 
 
399 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  46.61 
 
 
399 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  47.32 
 
 
389 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 
397 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  46.35 
 
 
399 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  43.02 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  45.11 
 
 
395 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  41 
 
 
403 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  47.46 
 
 
403 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.58 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  48.04 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.84 
 
 
393 aa  233  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  45.1 
 
 
415 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 
394 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  45.3 
 
 
394 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
396 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
415 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  46.32 
 
 
403 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 
407 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 
396 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  43.06 
 
 
405 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  40.33 
 
 
391 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  45.53 
 
 
410 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  42.06 
 
 
398 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  40.16 
 
 
398 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.96 
 
 
389 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.96 
 
 
389 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
389 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  45.86 
 
 
412 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  45.86 
 
 
412 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  45.86 
 
 
412 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.1 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.1 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.1 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.1 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.1 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  37.89 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 
406 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.95 
 
 
398 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.84 
 
 
394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 
419 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  42.36 
 
 
403 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  39.13 
 
 
399 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
406 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.28 
 
 
395 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  39.13 
 
 
399 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  39.13 
 
 
399 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  39.84 
 
 
394 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.84 
 
 
394 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  41.78 
 
 
405 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  41.78 
 
 
405 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.84 
 
 
394 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  48.84 
 
 
420 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  42.82 
 
 
400 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  40.61 
 
 
401 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  36.68 
 
 
399 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.33 
 
 
411 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.84 
 
 
394 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.36 
 
 
394 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  36.29 
 
 
407 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
391 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  36.41 
 
 
399 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
413 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.22 
 
 
405 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.85 
 
 
385 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.66 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  47.97 
 
 
410 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.94 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  46.96 
 
 
410 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.94 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  36.34 
 
 
399 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
408 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  46.88 
 
 
405 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  40.16 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  46.93 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  43.31 
 
 
403 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  37.85 
 
 
425 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  35.88 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  44.57 
 
 
402 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>