247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1082 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  69.77 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  62.28 
 
 		 299 aa  358  6e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  58.04 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  55.67 
 
 		 297 aa  298  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  55.4 
 
 		 299 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  52.88 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  52.88 
 
 		 279 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  52.88 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  55.48 
 
 		 285 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  55.29 
 
 		 287 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  54.86 
 
 		 289 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  51.92 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  54.8 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  54.51 
 
 		 287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  54.51 
 
 		 287 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  50.68 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  54.76 
 
 		 288 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  53.61 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  54.44 
 
 		 292 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  54.51 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  53.52 
 
 		 305 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  52.58 
 
 		 268 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  53.57 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  53.46 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  54.05 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  56.68 
 
 		 279 aa  269  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  50 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  48.43 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  51.76 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  50.37 
 
 		 272 aa  262  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  51.22 
 
 		 297 aa  261  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  53.9 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  55.81 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  52.46 
 
 		 283 aa  258  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  54.65 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  50.19 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  52.67 
 
 		 302 aa  255  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 282 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  47.13 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  49.61 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  48.25 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  46.04 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.95 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  49.03 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  48.82 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  47.97 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  48.08 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  48.08 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  48.08 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  47.45 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  47.69 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  47.69 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  47.69 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  45.96 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  45.66 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  45.96 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  44.29 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  46.67 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  43.98 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.6 
 
 		 175 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  44.84 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  60.45 
 
 		 147 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.3 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  42.68 
 
 		 241 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  40.75 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  47.67 
 
 		 225 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  50.63 
 
 		 266 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  49.68 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  46.24 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  37.18 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  38.62 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  38.15 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  48.41 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  52.32 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  37.61 
 
 		 216 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  45.73 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  44.26 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  36.54 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  50 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.14 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  48.7 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  49.66 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  37.1 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  49.01 
 
 		 240 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  37.97 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  45 
 
 		 229 aa  142  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  49.01 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  36.18 
 
 		 243 aa  142  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  38.99 
 
 		 242 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  44.97 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  39.81 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  51.75 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  37.65 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  40.28 
 
 		 217 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  44.65 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  44.65 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  44.65 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  46.15 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>