181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0662 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  73.65 
 
 		 195 aa  237  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  61.82 
 
 		 162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  61.21 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  60.37 
 
 		 156 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  59.64 
 
 		 166 aa  190  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  59.64 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  61.21 
 
 		 163 aa  185  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  58.43 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  55.69 
 
 		 158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  55.42 
 
 		 156 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  55.42 
 
 		 156 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  54.82 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  54.82 
 
 		 156 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  54.82 
 
 		 156 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  55.49 
 
 		 153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  53.61 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  53.05 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  53.05 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  53.61 
 
 		 156 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  53.05 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  43.71 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  42.77 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  43.71 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.56 
 
 		 155 aa  144  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  48.8 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  48.8 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  48.8 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  49.4 
 
 		 156 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  53.05 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  45.73 
 
 		 145 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  45.12 
 
 		 145 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  44.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  44.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  44.58 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  46.39 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  43.98 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  45.24 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  42.26 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  41.07 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  41.21 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  41.21 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  42.42 
 
 		 146 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  42.17 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  43.64 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  38.18 
 
 		 143 aa  99  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  38.15 
 
 		 157 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  58.82 
 
 		 97 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  44.07 
 
 		 1910 aa  65.1  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  32.06 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 552 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 511 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  52.08 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  39.44 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  44 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  44 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  42.59 
 
 		 405 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 1095 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  46.3 
 
 		 651 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 546 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  34.52 
 
 		 378 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2195  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000396131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 		 425 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  40.38 
 
 		 229 aa  51.6  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 546 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  34.52 
 
 		 374 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  34.52 
 
 		 374 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  42.59 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  35.87 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 322 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 349 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 572 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 345 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 388 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 339 aa  48.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  44.9 
 
 		 256 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  41.3 
 
 		 403 aa  47.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 440 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 380 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>