More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1447 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
399 aa  778  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  56.66 
 
 
384 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
385 aa  175  1e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 
411 aa  172  7e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 
391 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.91868e-06  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.79 
 
 
386 aa  134  4e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
407 aa  134  4e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 
404 aa  131  2e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25.83 
 
 
405 aa  128  2e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
420 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
400 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  28.09 
 
 
406 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
439 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  26.26 
 
 
474 aa  117  4e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
383 aa  117  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
400 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.72 
 
 
409 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  29.13 
 
 
390 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
414 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  26.45 
 
 
432 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  26.45 
 
 
432 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.47189e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  26.45 
 
 
432 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  26.45 
 
 
432 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  27.47 
 
 
409 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.39 
 
 
388 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  26.17 
 
 
409 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7408e-14 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
415 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  26.94 
 
 
392 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  27.14 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  27.27 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0628  major facilitator transporter  27.98 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0055005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0813  major facilitator family transporter  28.16 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  26.36 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  24.09 
 
 
404 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  26.85 
 
 
394 aa  94  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  28.49 
 
 
373 aa  92.8  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  26.77 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  26.36 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
392 aa  84.3  3e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
399 aa  83.6  5e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  22.56 
 
 
397 aa  81.6  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  25.14 
 
 
407 aa  82  2e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
414 aa  80.5  5e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0844  major facilitator transporter  28.05 
 
 
393 aa  80.5  5e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
388 aa  80.5  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.55 
 
 
437 aa  80.1  6e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  4.96056e-06 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  27.44 
 
 
415 aa  77.4  4e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  27.44 
 
 
415 aa  77.4  4e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  27.44 
 
 
415 aa  77.4  4e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.96 
 
 
461 aa  77.4  4e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  30.29 
 
 
474 aa  77.4  4e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  9.29318e-05  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.38 
 
 
415 aa  77  5e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.03 
 
 
399 aa  77  5e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  23.7 
 
 
395 aa  76.6  7e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  28.25 
 
 
401 aa  76.3  8e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.16 
 
 
462 aa  76.6  8e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  8.04058e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.85 
 
 
469 aa  76.3  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  27.48 
 
 
399 aa  75.5  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  27 
 
 
415 aa  75.5  2e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.66 
 
 
384 aa  75.1  2e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.67 
 
 
381 aa  75.1  2e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
381 aa  74.7  2e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.67 
 
 
381 aa  75.1  2e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
399 aa  74.3  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
423 aa  74.7  3e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  27.31 
 
 
420 aa  74.3  3e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  26.2 
 
 
397 aa  74.3  3e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.51 
 
 
417 aa  73.9  4e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.4 
 
 
381 aa  74.3  4e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.56 
 
 
398 aa  73.9  4e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
421 aa  74.3  4e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
381 aa  73.9  5e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.67 
 
 
392 aa  73.9  5e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 
402 aa  73.6  6e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.53 
 
 
402 aa  73.6  6e-12  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.41 
 
 
437 aa  73.2  8e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.7 
 
 
421 aa  73.2  8e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  24.53 
 
 
383 aa  73.2  8e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.14 
 
 
381 aa  72.8  9e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.8 
 
 
381 aa  72.4  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  25.41 
 
 
394 aa  72.8  1e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  27.54 
 
 
401 aa  72.8  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
414 aa  72  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.53 
 
 
421 aa  72  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2460  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 
403 aa  72  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.35 
 
 
403 aa  72  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.65 
 
 
421 aa  71.2  3e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.07 
 
 
381 aa  71.2  3e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  28.44 
 
 
403 aa  71.2  3e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.82 
 
 
435 aa  71.2  3e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  1.85611e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.73 
 
 
480 aa  70.9  4e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.73 
 
 
532 aa  70.9  4e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.48 
 
 
401 aa  70.5  4e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 
476 aa  70.9  4e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.56155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0630  major facilitator family transporter  25.09 
 
 
441 aa  70.9  4e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.94 
 
 
408 aa  70.9  4e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>