More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8517 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
326 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  76.51 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  53.25 
 
 
333 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  54.15 
 
 
322 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0206  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.23 
 
 
348 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.79 
 
 
323 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2480  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.28 
 
 
288 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459764  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  45.07 
 
 
323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.75 
 
 
338 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.54 
 
 
320 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  34.82 
 
 
317 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.77 
 
 
318 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  35.67 
 
 
321 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.26 
 
 
317 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.56 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.03 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.65 
 
 
326 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.78 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38755  predicted protein  31.78 
 
 
343 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.172  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.59 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  32.51 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5032  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.9 
 
 
157 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.44 
 
 
325 aa  126  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 
295 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.93 
 
 
323 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.09 
 
 
319 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04268  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03850)  36.62 
 
 
356 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00389838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4576  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.93 
 
 
330 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.403113  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.33 
 
 
316 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2021  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.67 
 
 
331 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.01256  normal  0.586253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2151  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.79 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1483  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.36 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.55 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.32 
 
 
345 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.38 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.38 
 
 
328 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.79 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.78 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  33.76 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4186  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.86 
 
 
329 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.71 
 
 
328 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.82 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.58 
 
 
324 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04120  oxidoreductase 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17430)  33.84 
 
 
380 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3976  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.72 
 
 
341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.12 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.59 
 
 
324 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.67 
 
 
354 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.23 
 
 
506 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.25 
 
 
305 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.84 
 
 
377 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01050  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  33.54 
 
 
314 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.250641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5434  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.12 
 
 
323 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.295794  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.5 
 
 
314 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.5 
 
 
314 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00985  putative dioxygenase  30.84 
 
 
314 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.99 
 
 
319 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  32.49 
 
 
321 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.29 
 
 
324 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.63 
 
 
324 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.64 
 
 
380 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  31.29 
 
 
323 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.02 
 
 
316 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.87 
 
 
362 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.07 
 
 
350 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.18 
 
 
316 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28800  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  29.67 
 
 
324 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.135482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.27 
 
 
369 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.59 
 
 
324 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  32.26 
 
 
346 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.13 
 
 
329 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.65 
 
 
325 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.89 
 
 
315 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.16 
 
 
355 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.16 
 
 
355 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.25 
 
 
354 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.02 
 
 
492 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0826  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.57 
 
 
332 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.289165  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4367  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.84 
 
 
325 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3672  2-nitropropane dioxygenase  30.75 
 
 
311 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.58 
 
 
305 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  30.37 
 
 
409 aa  103  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.12 
 
 
323 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4936  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.43 
 
 
492 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.121654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0738  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.91 
 
 
325 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11052  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6901  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.27 
 
 
328 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  31.47 
 
 
334 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.58 
 
 
323 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3758  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.53 
 
 
334 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.23 
 
 
341 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.43 
 
 
331 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2031  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.79 
 
 
342 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0098  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.96 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.718222  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43560  predicted protein  29.36 
 
 
361 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.14 
 
 
317 aa  99.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>