More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4535 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 359 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.54 
 
 		 358 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.57 
 
 		 358 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.29 
 
 		 358 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.65 
 
 		 358 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  84.59 
 
 		 359 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  64.39 
 
 		 374 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.78 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.51 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.51 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.46 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  56.51 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.08 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.18 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  58.11 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.22 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.78 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.48 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.48 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  59.32 
 
 		 361 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.52 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.23 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.35 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.52 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.24 
 
 		 349 aa  322  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.62 
 
 		 356 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 		 357 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.35 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.84 
 
 		 367 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.2 
 
 		 343 aa  305  8.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.12 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.6 
 
 		 352 aa  299  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.78 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 355 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.29 
 
 		 384 aa  289  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  45 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.96 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.2 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.74 
 
 		 355 aa  273  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.86 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  44.64 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.1 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  49.16 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  49.16 
 
 		 363 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.57 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.69 
 
 		 354 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.37 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.31 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 		 333 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.53 
 
 		 333 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.41 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  47.22 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.7 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  44.97 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  43.64 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.18 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.49 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.89 
 
 		 345 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.6 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.48 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.44 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  49.24 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  50.14 
 
 		 370 aa  255  9e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  43.14 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.57 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.5 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.8 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.85 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.35 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 361 aa  252  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  43.99 
 
 		 377 aa  252  7e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.36 
 
 		 350 aa  251  9.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.91 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.89 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  42.48 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  41.93 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  48.1 
 
 		 389 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.85 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  42.52 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>