28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3831 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3831  putative phage repressor  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  36.22 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  34.89 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1918  putative phage repressor  37.93 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2405  putative phage repressor  43.44 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  29.49 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  32.89 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  36.97 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5792  putative phage repressor  34.12 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2321  putative phage repressor  30.84 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2209  putative phage repressor  28.15 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111819 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0258  putative phage repressor  25.2 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  36.75 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  35.2 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  31.3 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  35.71 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  29.5 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  32.85 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  32.76 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  39.74 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  33.9 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  32.23 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  24.19 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  33.04 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  33.33 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  35 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  31.71 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>