More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1712 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 138 aa  268  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  92.75 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  78.99 
 
 		 138 aa  216  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  78.79 
 
 		 133 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  78.2 
 
 		 133 aa  215  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  77.69 
 
 		 135 aa  213  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  82.61 
 
 		 138 aa  210  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  79.69 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  77.86 
 
 		 137 aa  209  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  77.86 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  82.68 
 
 		 136 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  76.15 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  76.34 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  76.34 
 
 		 138 aa  207  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 		 133 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  84.78 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  84.78 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  73.53 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  73.28 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  75.76 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  79.55 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  75 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  75 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  74.05 
 
 		 135 aa  200  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  78.51 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  68.38 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  71.97 
 
 		 132 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.88 
 
 		 128 aa  193  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  72.87 
 
 		 134 aa  191  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  70.45 
 
 		 151 aa  189  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  68.94 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  65.19 
 
 		 347 aa  183  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  75.21 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  66.15 
 
 		 334 aa  173  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  65.83 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  54.89 
 
 		 138 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  58.21 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  47.73 
 
 		 318 aa  116  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45.83 
 
 		 312 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44.09 
 
 		 315 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  47.24 
 
 		 316 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.19 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  44.36 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  43.31 
 
 		 315 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.88 
 
 		 313 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.11 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.44 
 
 		 306 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.11 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.53 
 
 		 310 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  44.7 
 
 		 320 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  43.31 
 
 		 314 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  43.31 
 
 		 314 aa  95.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.11 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  43.94 
 
 		 320 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  42.52 
 
 		 314 aa  94.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.68 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 129 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.73 
 
 		 316 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  42.86 
 
 		 329 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.94 
 
 		 316 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 329 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  42.52 
 
 		 314 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.07 
 
 		 302 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.73 
 
 		 314 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  48.89 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  40.16 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 149 aa  90.5  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.71 
 
 		 360 aa  90.5  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  41.32 
 
 		 315 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 329 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  39.53 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  42.97 
 
 		 400 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  39.68 
 
 		 321 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  48.89 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.18 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>