More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1502 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1502  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  267  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000371011  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  50.68 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  39.09 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  36.45 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  50.77 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  36.63 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  36.45 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  38.78 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  41.38 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  49.23 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  36.27 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  49.3 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  36.27 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  34.34 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  36.36 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  34.34 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  46.58 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  43.28 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.71 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  34.74 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2952  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.13 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  39.13 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  33.33 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.94 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  46.38 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  36.36 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.63 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0706  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.5 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  39.71 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  36.26 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 339 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 127 aa  57  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  44.78 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.14 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.63 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  35.63 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.63 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  35.63 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.65 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  32.65 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  37.18 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  29.17 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  39.68 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>