224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0865 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 59 aa  120  7e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  52.83 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 56 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09820  LSU ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0340252  hitchhiker  0.0000167701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1465  50S ribosomal protein L30  54.72 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0308  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.19887e-28 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  45.76 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 58 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1372  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.63602  normal  0.121983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3649  50S ribosomal protein L30  42.11 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000866459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5052  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2442  50S ribosomal protein L30P  40.35 
 
 		 60 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  50.94 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0297  50S ribosomal protein L30P  47.27 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000000859668  hitchhiker  0.00000207421 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1004  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0620766  decreased coverage  0.00478074 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3649  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  40.68 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2313  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.415708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  41.82 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1861  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  42.37 
 
 		 59 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2307  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227659  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>