156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1469 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  47.84 
 
 
279 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  45.13 
 
 
302 aa  255  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  43.01 
 
 
283 aa  245  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  42.07 
 
 
278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  44.4 
 
 
279 aa  228  9e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  39.34 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  40.96 
 
 
274 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  37.18 
 
 
283 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  37.28 
 
 
291 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  37.98 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  33.45 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  34.32 
 
 
298 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  32.48 
 
 
293 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  34.01 
 
 
291 aa  159  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  35.71 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  35.41 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  29.79 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
275 aa  132  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  29.37 
 
 
274 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  31.02 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  31.75 
 
 
277 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.86 
 
 
279 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  29.57 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  26.15 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  32.72 
 
 
295 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  31.16 
 
 
323 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  29.56 
 
 
279 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  33.65 
 
 
254 aa  105  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  29.6 
 
 
268 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  30 
 
 
287 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.37 
 
 
268 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  32.23 
 
 
254 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  26.41 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  29.12 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  31.96 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  30.09 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1224  hypothetical protein  25.94 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0472515 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  26.67 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  28.63 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  23.72 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  30.96 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  29.61 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  24.1 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  34.9 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  31.41 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  34.23 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  24.74 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  26.51 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  26.42 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  28.51 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  24.78 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  32.89 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  30.17 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  25.51 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  29.94 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  31.01 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.28 
 
 
352 aa  60.1  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
217 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  36.19 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
256 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.58 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  29.93 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.59 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  28.4 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  24.14 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  30.58 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
210 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
218 aa  52.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  31.62 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.81 
 
 
254 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  22.97 
 
 
237 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  31.48 
 
 
270 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
217 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  26.36 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  25.47 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5724  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
143 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262167  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  26.21 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  22.69 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.04 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  27.78 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  29.73 
 
 
121 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  35.23 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.97 
 
 
296 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  27 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  21.13 
 
 
239 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  21.13 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  30.49 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.84 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
210 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>