116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0058 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  100 
 
 
200 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  93 
 
 
200 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  93.5 
 
 
200 aa  370  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  74.87 
 
 
199 aa  310  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  57.58 
 
 
196 aa  216  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  40.39 
 
 
213 aa  131  8e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  41.88 
 
 
209 aa  125  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  38.94 
 
 
230 aa  122  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  42.35 
 
 
212 aa  120  2e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  38.1 
 
 
222 aa  113  2e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  44.97 
 
 
224 aa  110  2e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  35.91 
 
 
208 aa  110  2e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  43.42 
 
 
224 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  38.3 
 
 
207 aa  108  4e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  39.44 
 
 
198 aa  104  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  43.71 
 
 
212 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  45.89 
 
 
201 aa  102  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  42.34 
 
 
214 aa  101  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  38.22 
 
 
212 aa  94.7  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  34.47 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  37.31 
 
 
201 aa  82.8  3e-15  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  41.73 
 
 
201 aa  83.2  3e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  31.34 
 
 
208 aa  80.1  2e-14  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  32.52 
 
 
201 aa  77.8  1e-13  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  34.34 
 
 
203 aa  75.5  5e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  38.24 
 
 
186 aa  75.1  7e-13  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  30.59 
 
 
184 aa  70.5  2e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  43.14 
 
 
207 aa  69.3  4e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  33.33 
 
 
392 aa  60.8  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  33.77 
 
 
209 aa  54.7  9e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1737  peptidase M50  30.83 
 
 
201 aa  54.3  1e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  33.33 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  46.77 
 
 
285 aa  53.1  3e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  32 
 
 
412 aa  52.4  4e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 
343 aa  52  6e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  29.32 
 
 
373 aa  52  6e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  36.76 
 
 
207 aa  51.6  8e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  27.98 
 
 
220 aa  51.6  9e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4056  peptidase M50  30.11 
 
 
276 aa  50.1  2e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  31.93 
 
 
412 aa  50.4  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  29.01 
 
 
371 aa  50.1  2e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  29.77 
 
 
370 aa  50.1  2e-05  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  34.23 
 
 
405 aa  50.4  2e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  36.36 
 
 
224 aa  49.7  3e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  27.78 
 
 
361 aa  49.3  4e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  28.57 
 
 
373 aa  48.5  6e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  26.67 
 
 
390 aa  48.5  7e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  32.62 
 
 
223 aa  48.1  8e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2101  M50 family peptidase  29.5 
 
 
284 aa  48.1  9e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00808635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0098  peptidase M50  28.67 
 
 
269 aa  48.1  9e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  28.67 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  28.12 
 
 
370 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  27.78 
 
 
370 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2389  M50 family peptidase  30.6 
 
 
284 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  30.16 
 
 
375 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  29.93 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  30.34 
 
 
379 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  28.67 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  28.24 
 
 
364 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  26.71 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  29.63 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  29.7 
 
 
221 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  30.43 
 
 
202 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  29.93 
 
 
359 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  27.46 
 
 
394 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  26.95 
 
 
258 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  27.97 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3354  peptidase M50  32.24 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.3117e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  25.16 
 
 
400 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  29.86 
 
 
216 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  29.77 
 
 
413 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  31.76 
 
 
373 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  32.47 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  26.76 
 
 
383 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  43.28 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.34184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  28.35 
 
 
342 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  28.35 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  27.59 
 
 
424 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  28.08 
 
 
375 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_27960  predicted protein  28.69 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3898  peptidase M50  30.61 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  29.92 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  31.06 
 
 
393 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  27.34 
 
 
395 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  25.36 
 
 
362 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  29.05 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  28.67 
 
 
372 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  33.11 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  25.56 
 
 
376 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  29.73 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  26.98 
 
 
337 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  28.12 
 
 
380 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  29.45 
 
 
378 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  36.99 
 
 
379 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.36286e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  31.08 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  28.03 
 
 
376 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  34 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.43376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  31.97 
 
 
372 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>