74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0459 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  56.03 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 		 240 aa  88.2  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 137 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  51.61 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  42.74 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  56.16 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  41.59 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  42.42 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  37.59 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  33.9 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  38.89 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  44.76 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  45.05 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  41.11 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  45.95 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  32.31 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  43.75 
 
 		 132 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  42.55 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  34.86 
 
 		 119 aa  52  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  33.93 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  30.07 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  30.47 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 111 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  39.68 
 
 		 121 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  39.32 
 
 		 122 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  38.26 
 
 		 136 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 		 122 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  34.38 
 
 		 119 aa  48.5  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  33.08 
 
 		 141 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 		 113 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  34.17 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  30.83 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  28.85 
 
 		 116 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  31.62 
 
 		 123 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  44.3 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  40.62 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 113 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  43.64 
 
 		 120 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  32.53 
 
 		 113 aa  45.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  39.68 
 
 		 110 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35.8 
 
 		 116 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  54.35 
 
 		 126 aa  44.7  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 115 aa  44.7  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.67 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  35.25 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35.8 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  35.94 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  31.67 
 
 		 108 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  54.35 
 
 		 126 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  34.33 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  30.83 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  36.75 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  39.06 
 
 		 115 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.18 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 115 aa  42.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 123 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  36.29 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  32.86 
 
 		 109 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  34.86 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 		 109 aa  42  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 112 aa  41.2  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 91 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 		 93 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>