More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2574 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
339 aa  695    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  66.97 
 
 
335 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  58.31 
 
 
349 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  55.33 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  58.06 
 
 
334 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  57.79 
 
 
333 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  55.56 
 
 
326 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  53.99 
 
 
374 aa  377  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  54.63 
 
 
374 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 
333 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  54.69 
 
 
332 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  53.72 
 
 
333 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  53.72 
 
 
333 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  54.37 
 
 
332 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  54.26 
 
 
372 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  54.05 
 
 
333 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  51.49 
 
 
334 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  52.75 
 
 
333 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  51.78 
 
 
333 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  52.29 
 
 
345 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  45.59 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  47.53 
 
 
355 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  43.87 
 
 
355 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 
349 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  49.37 
 
 
345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  45.54 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  45.54 
 
 
365 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  46.45 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  46.32 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  41.93 
 
 
337 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.41 
 
 
341 aa  277  2e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  43.67 
 
 
341 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  42.94 
 
 
340 aa  275  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  44.41 
 
 
366 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  41.07 
 
 
350 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
335 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  38.73 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  41.07 
 
 
350 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 
335 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 
349 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 
335 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
347 aa  266  5e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  41.72 
 
 
335 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  41.4 
 
 
335 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  41.54 
 
 
337 aa  265  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  40.49 
 
 
335 aa  264  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 
346 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 
335 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  41.38 
 
 
338 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 
335 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  41.74 
 
 
336 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  38.01 
 
 
339 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 
335 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  41.08 
 
 
338 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  41.01 
 
 
336 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  41.25 
 
 
348 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  36.6 
 
 
335 aa  257  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  38.23 
 
 
335 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  42.01 
 
 
349 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  40.61 
 
 
338 aa  256  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  37.93 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  40.13 
 
 
337 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  40.59 
 
 
347 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  41.87 
 
 
338 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  37.46 
 
 
337 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  40.97 
 
 
380 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 
345 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 
337 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  38.42 
 
 
347 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  37.5 
 
 
337 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  39.44 
 
 
337 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 
362 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
337 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
336 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  40.31 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  36.89 
 
 
337 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  38.62 
 
 
335 aa  245  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  40.19 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  40.62 
 
 
354 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 
335 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.88 
 
 
336 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  38.72 
 
 
352 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  37.85 
 
 
336 aa  240  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 
339 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  39.17 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  35.61 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.13 
 
 
351 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  40.13 
 
 
351 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  39.48 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  40.13 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  39.14 
 
 
347 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.81 
 
 
351 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  37.69 
 
 
335 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.81 
 
 
351 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  39.81 
 
 
351 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 
353 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>