More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4857 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
315 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
315 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  98.1 
 
 
341 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  67.08 
 
 
322 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  59.15 
 
 
312 aa  359  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  56.96 
 
 
337 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 
315 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  44.73 
 
 
315 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
315 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  47.47 
 
 
317 aa  252  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
328 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  47.47 
 
 
302 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 
323 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  48.04 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  41.19 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  41.93 
 
 
314 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  43.79 
 
 
330 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
308 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 
315 aa  222  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  45.94 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  41.14 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  42.58 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
324 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
331 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  40.25 
 
 
331 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
323 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 
344 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 
343 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  34.37 
 
 
351 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.75 
 
 
356 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  38.77 
 
 
321 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.24 
 
 
350 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
351 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.18 
 
 
288 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
304 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
434 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
376 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
290 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  33.42 
 
 
434 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
288 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  32.79 
 
 
371 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
367 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
367 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.35 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.94 
 
 
293 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
284 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  33.77 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
287 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
300 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  31.01 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
291 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
291 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  34.93 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  32.59 
 
 
356 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
286 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
291 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
291 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
308 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
291 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 
297 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.47 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
390 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  29.87 
 
 
311 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  32.25 
 
 
494 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
292 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
283 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
284 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
284 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
271 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>