54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3672 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  286  7e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  92.2 
 
 
137 aa  260  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  92.2 
 
 
137 aa  260  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  82.73 
 
 
146 aa  234  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  83.45 
 
 
146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  69.72 
 
 
138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  54.01 
 
 
143 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  45.97 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3365  hypothetical protein  35.16 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.810777  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2863  hypothetical protein  35.16 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580018  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3014  hypothetical protein  32.19 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.764426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3029  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417482  normal  0.14022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3060  hypothetical protein  32.19 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  37.38 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  28.04 
 
 
413 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  32.81 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3555  hypothetical protein  34.88 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  31.45 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8927  hypothetical protein  31.2 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3567  hypothetical protein  30.61 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  30.47 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  23.39 
 
 
178 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  30.89 
 
 
182 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  28 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11644  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.187499  normal  0.695339 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  26.43 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  25.18 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.43 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  25.18 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  28.93 
 
 
576 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  27.66 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  28.91 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0940  hypothetical protein  29.32 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  29.36 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4526  hypothetical protein  32.39 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0992548  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.93 
 
 
134 aa  48.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  33.01 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  29.69 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.63 
 
 
140 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  28.85 
 
 
133 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17870  predicted nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  36.54 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  0.638502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  30.65 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3624  hypothetical protein  29.1 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.16 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  26.09 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.04 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4111  hypothetical protein  33.83 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0961571  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  27.87 
 
 
550 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  27.87 
 
 
550 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.64 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  27.1 
 
 
319 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  26.67 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>