More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3522 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
86 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
86 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  100 
 
 
86 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 
86 aa  141  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  82.56 
 
 
86 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  80.23 
 
 
86 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  83.72 
 
 
86 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  81.4 
 
 
86 aa  134  6e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  69.77 
 
 
86 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
88 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  67.44 
 
 
86 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  65.12 
 
 
92 aa  106  8e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 
86 aa  106  9e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53249e-08 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  71.25 
 
 
89 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
89 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  73.33 
 
 
86 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
88 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  69.62 
 
 
95 aa  104  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  70.13 
 
 
151 aa  104  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
88 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  70 
 
 
90 aa  103  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  68.75 
 
 
86 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  73.26 
 
 
86 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 
86 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  67.5 
 
 
86 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  67.44 
 
 
86 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  67.5 
 
 
90 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  65.85 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  68.6 
 
 
86 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  65.12 
 
 
86 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 
86 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  60.47 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  61.25 
 
 
86 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  61.25 
 
 
88 aa  92  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  59.49 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.27538e-06  unclonable  1.13677e-09 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  58.75 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  59.49 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  65 
 
 
88 aa  82.4  2e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 
89 aa  81.6  3e-15  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  52.33 
 
 
87 aa  81.6  3e-15  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  63.75 
 
 
88 aa  81.6  3e-15  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  59.49 
 
 
172 aa  80.9  6e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 
89 aa  80.5  8e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.40091e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  51.16 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  48.24 
 
 
105 aa  74.7  4e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  51.76 
 
 
89 aa  73.9  6e-13  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  46.51 
 
 
88 aa  74.3  6e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  47.67 
 
 
88 aa  70.5  8e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
88 aa  70.5  8e-12  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  46.43 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  68.6  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0759  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  68.6  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 
94 aa  67.8  4e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.34662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 
94 aa  67.8  5e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7573e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  67.4  6e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  67.4  7e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
88 aa  67.4  7e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.7 
 
 
87 aa  66.2  1e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 
85 aa  66.6  1e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 
90 aa  66.6  1e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.26326e-09  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 
92 aa  66.2  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  46.51 
 
 
86 aa  66.2  1e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 
85 aa  66.6  1e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 
91 aa  65.9  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.86 
 
 
88 aa  65.5  2e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.91631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  44.05 
 
 
85 aa  65.5  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.76977e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 
91 aa  65.9  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53456e-13 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 
96 aa  65.1  3e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  3.00859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.15322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.91712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  48.1 
 
 
100 aa  65.1  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 
85 aa  65.1  3e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 
87 aa  65.1  3e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31209e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  45.35 
 
 
87 aa  64.7  4e-10  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 
87 aa  64.7  4e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.43906e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 
88 aa  64.3  5e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 
90 aa  63.9  6e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.59944e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  46.24 
 
 
98 aa  63.9  6e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 
85 aa  63.9  7e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  1.17943e-11 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
99 aa  63.5  9e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 
90 aa  63.2  1e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0238  30S ribosomal protein S20  49.33 
 
 
85 aa  62.8  1e-09  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00017388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 
91 aa  62  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  5.03412e-05 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 
98 aa  62.4  2e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  44.68 
 
 
98 aa  62.4  2e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>