More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2219 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  55.19 
 
 
879 aa  1012    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
885 aa  1835    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  59.09 
 
 
896 aa  1082    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  68.22 
 
 
878 aa  1265    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  63.89 
 
 
880 aa  1206    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  56.1 
 
 
394 aa  452  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  54.81 
 
 
394 aa  434  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  53.26 
 
 
393 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  50.77 
 
 
393 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  47.72 
 
 
393 aa  347  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.79 
 
 
409 aa  327  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.25 
 
 
415 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  44.22 
 
 
392 aa  319  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40 
 
 
429 aa  318  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.71 
 
 
404 aa  317  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.39 
 
 
412 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  36.44 
 
 
667 aa  310  8e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.21 
 
 
406 aa  308  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.63 
 
 
414 aa  308  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.73 
 
 
412 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.31 
 
 
414 aa  307  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.61 
 
 
414 aa  306  9.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.36 
 
 
406 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  40.54 
 
 
420 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.75 
 
 
408 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.81 
 
 
406 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.81 
 
 
406 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.14 
 
 
414 aa  303  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  44.27 
 
 
408 aa  303  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.55 
 
 
415 aa  302  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.83 
 
 
420 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.75 
 
 
414 aa  301  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  41.56 
 
 
406 aa  301  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.32 
 
 
418 aa  301  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  41.56 
 
 
406 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  41.56 
 
 
406 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  40.49 
 
 
423 aa  301  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  41.56 
 
 
406 aa  300  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  41.56 
 
 
406 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  41.56 
 
 
406 aa  300  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40 
 
 
415 aa  300  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.14 
 
 
408 aa  300  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  42.43 
 
 
420 aa  299  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.11 
 
 
420 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.06 
 
 
406 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  41.56 
 
 
406 aa  298  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.25 
 
 
404 aa  297  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.31 
 
 
406 aa  297  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.4 
 
 
418 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.65 
 
 
414 aa  296  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.2 
 
 
421 aa  296  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.45 
 
 
418 aa  296  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  39.45 
 
 
414 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.06 
 
 
429 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.31 
 
 
429 aa  296  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  39.04 
 
 
412 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  39.56 
 
 
420 aa  294  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  39.65 
 
 
414 aa  294  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.88 
 
 
451 aa  293  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  38.71 
 
 
410 aa  293  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.22 
 
 
433 aa  293  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.65 
 
 
415 aa  293  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.51 
 
 
413 aa  292  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.51 
 
 
413 aa  292  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  39.61 
 
 
424 aa  291  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.28 
 
 
417 aa  291  4e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  32.58 
 
 
796 aa  290  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.81 
 
 
429 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.94 
 
 
416 aa  290  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.09 
 
 
416 aa  290  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  39.5 
 
 
413 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  39.11 
 
 
434 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.32 
 
 
425 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.22 
 
 
412 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  37.59 
 
 
416 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.9 
 
 
443 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
429 aa  287  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  40.45 
 
 
405 aa  287  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  37.81 
 
 
410 aa  287  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  41.78 
 
 
404 aa  287  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.69 
 
 
406 aa  286  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.97 
 
 
428 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.02 
 
 
406 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.25 
 
 
404 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  39.9 
 
 
395 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  41.15 
 
 
403 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.35 
 
 
414 aa  284  5.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.1 
 
 
412 aa  283  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  38.39 
 
 
429 aa  283  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  40.45 
 
 
414 aa  283  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  38.14 
 
 
421 aa  283  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  39.66 
 
 
419 aa  283  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  40.6 
 
 
416 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 
411 aa  283  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  37.56 
 
 
404 aa  282  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.14 
 
 
414 aa  282  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.55 
 
 
419 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.19 
 
 
435 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.46 
 
 
417 aa  281  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  39.1 
 
 
405 aa  281  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>