47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1750 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  100 
 
 
515 aa  1062  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  24.4 
 
 
490 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.24034e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  24.5 
 
 
486 aa  85.9  2e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  25.12 
 
 
602 aa  67.8  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.96112e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  29.12 
 
 
597 aa  65.9  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  26.35 
 
 
549 aa  64.7  4e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  24.77 
 
 
544 aa  61.6  3e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  42.5 
 
 
352 aa  57.4  5e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  39.45 
 
 
562 aa  57  7e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  24.41 
 
 
573 aa  56.2  1e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  40.51 
 
 
353 aa  54.7  4e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  30.83 
 
 
577 aa  50.8  6e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  36.54 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  29.76 
 
 
518 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  31.63 
 
 
712 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30.6 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  29.32 
 
 
582 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  46.67 
 
 
582 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  31.9 
 
 
623 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  34.41 
 
 
440 aa  47.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  34.15 
 
 
452 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  34.09 
 
 
203 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  33.71 
 
 
484 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  34.72 
 
 
598 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  45.65 
 
 
648 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  29.9 
 
 
619 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  27.59 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  24.94 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  33.66 
 
 
410 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  46.94 
 
 
410 aa  44.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  36.71 
 
 
368 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  28.71 
 
 
619 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.82 
 
 
573 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1514  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  29.91 
 
 
226 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2370  AAA ATPase  21.43 
 
 
454 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  26.85 
 
 
606 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  35.71 
 
 
424 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.18 
 
 
626 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  32.35 
 
 
888 aa  44.3  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  34.29 
 
 
364 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.44 
 
 
578 aa  43.9  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  30 
 
 
430 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  39.13 
 
 
604 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  30.56 
 
 
345 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  37.68 
 
 
422 aa  43.5  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  40.82 
 
 
403 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  33.96 
 
 
814 aa  43.5  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.66162e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>