85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0145 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1061    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  41.57 
 
 		 518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  32.22 
 
 		 544 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  28.39 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  22.57 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  30.47 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  24.94 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  24.83 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  23.39 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  27.59 
 
 		 558 aa  51.2  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  36.92 
 
 		 264 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  42.86 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0944  ABC transporter related  44.44 
 
 		 244 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0908  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1047  ABC transporter related  44.83 
 
 		 244 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  41.07 
 
 		 313 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  32.26 
 
 		 247 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 264 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4187  ABC transporter related  36.92 
 
 		 250 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  34.85 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  36 
 
 		 369 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  39.68 
 
 		 259 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 278 aa  47  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  60.61 
 
 		 270 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  27.47 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  29.76 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  28.83 
 
 		 261 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  41.07 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  31.3 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  46.94 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  44.68 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1324  ABC transporter related  26.51 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  62.5 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 247 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1060  ABC transporter related  44.44 
 
 		 230 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.724138  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2442  ABC transporter related  44.23 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0120547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  39.06 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  64.29 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2746  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  45.71 
 
 		 585 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  37.29 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  32.97 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  36 
 
 		 263 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4015  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  36.23 
 
 		 556 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  41.07 
 
 		 241 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3356  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  36.11 
 
 		 296 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  37.84 
 
 		 599 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  36 
 
 		 654 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  39.29 
 
 		 260 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  40.43 
 
 		 260 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0161  ABC transporter related  38.1 
 
 		 271 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.275609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6344  AAA ATPase  33.33 
 
 		 537 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40 
 
 		 251 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40 
 
 		 251 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 		 374 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  36.23 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  32.86 
 
 		 261 aa  44.3  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6287  ABC transporter related protein  28.68 
 
 		 264 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 263 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  28.57 
 
 		 285 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 290 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  40.43 
 
 		 669 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  34.67 
 
 		 277 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00360  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  24.43 
 
 		 636 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1756  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 		 334 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.215273  hitchhiker  0.00900194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.82 
 
 		 277 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2678  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 249 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  37.5 
 
 		 261 aa  43.9  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  24.41 
 
 		 233 aa  43.9  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  40.82 
 
 		 277 aa  43.9  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 246 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 244 aa  43.9  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 288 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  45.9 
 
 		 257 aa  43.9  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  33.85 
 
 		 272 aa  43.5  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  41.86 
 
 		 260 aa  43.5  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  36 
 
 		 271 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  43.5  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  48.72 
 
 		 254 aa  43.5  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  39.29 
 
 		 235 aa  43.5  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  26.23 
 
 		 270 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>