114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4927 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1116    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  46.05 
 
 
550 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  40.89 
 
 
508 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  40.89 
 
 
508 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  40.37 
 
 
514 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  40.07 
 
 
535 aa  330  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  37.79 
 
 
586 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  36.83 
 
 
571 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  40.04 
 
 
508 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  40.04 
 
 
508 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  40.42 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  40.14 
 
 
519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  39.85 
 
 
582 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  37.01 
 
 
593 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.46 
 
 
517 aa  310  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  40.89 
 
 
516 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  40.93 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  41.92 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  41.92 
 
 
491 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  41.92 
 
 
491 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  43.03 
 
 
519 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  39.81 
 
 
524 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  38.52 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  38.52 
 
 
480 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  38.52 
 
 
480 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  36.45 
 
 
539 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  54.27 
 
 
620 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  35.45 
 
 
512 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  34.31 
 
 
511 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  36.26 
 
 
550 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  36.36 
 
 
488 aa  257  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  36.61 
 
 
464 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  37.73 
 
 
473 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  40.32 
 
 
516 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  33.03 
 
 
567 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  33.4 
 
 
484 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  39.55 
 
 
441 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  39.29 
 
 
581 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  39.29 
 
 
581 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  38.93 
 
 
578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  38.93 
 
 
578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  46.12 
 
 
593 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  46.12 
 
 
593 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  51.61 
 
 
578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  46.26 
 
 
601 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  38.01 
 
 
601 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  38.21 
 
 
578 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  25.93 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  27.34 
 
 
566 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  26.63 
 
 
579 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  49.5 
 
 
635 aa  88.2  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  48.12 
 
 
129 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  29.26 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  45.74 
 
 
535 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  45.65 
 
 
714 aa  77.8  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  42.86 
 
 
620 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  26.09 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  28.12 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  39.33 
 
 
748 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  40.96 
 
 
709 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  39.64 
 
 
498 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  42.17 
 
 
637 aa  69.3  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  27.19 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  26.91 
 
 
499 aa  68.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  39.29 
 
 
743 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  43.3 
 
 
602 aa  66.6  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  40.57 
 
 
530 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  47.37 
 
 
603 aa  64.7  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  39.2 
 
 
566 aa  64.3  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  27.08 
 
 
535 aa  63.9  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  45.16 
 
 
122 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  35.94 
 
 
556 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  41.67 
 
 
620 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  41.67 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  40.62 
 
 
568 aa  60.5  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  25.19 
 
 
558 aa  60.1  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  32.48 
 
 
567 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  35.71 
 
 
443 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  35.71 
 
 
443 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.48 
 
 
510 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  39.36 
 
 
628 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  41.3 
 
 
605 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  37.23 
 
 
426 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  44.78 
 
 
580 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  40 
 
 
584 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  23.04 
 
 
512 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  25.5 
 
 
442 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  24.46 
 
 
432 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  40.43 
 
 
547 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  33.33 
 
 
507 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  36.36 
 
 
198 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  34.55 
 
 
565 aa  51.6  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  28.98 
 
 
586 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  35.63 
 
 
117 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  38.61 
 
 
457 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  29.23 
 
 
572 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  29.23 
 
 
557 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  35.63 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  29.14 
 
 
554 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  24.1 
 
 
427 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>