105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3858 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  259  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  86.61 
 
 
134 aa  195  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  70.23 
 
 
134 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  68.7 
 
 
134 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  68.7 
 
 
134 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  69.29 
 
 
135 aa  170  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  68.5 
 
 
136 aa  168  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  64.84 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  64.84 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  58.59 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  62.39 
 
 
127 aa  146  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  58.33 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  59.69 
 
 
135 aa  143  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  61.11 
 
 
133 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  58.46 
 
 
132 aa  136  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  63.78 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  55.91 
 
 
132 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  52.34 
 
 
132 aa  130  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  53.44 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  54.89 
 
 
135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  58.73 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  57.03 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  53.49 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  53.08 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  56.35 
 
 
133 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  54.69 
 
 
133 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  48.18 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  48.55 
 
 
141 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  57.02 
 
 
163 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  40.48 
 
 
138 aa  84.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.33 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  36.28 
 
 
263 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  46.77 
 
 
140 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  36.11 
 
 
262 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  36.11 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.88 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  36.11 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  36.11 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  36.11 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  36.11 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  45.16 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  44.12 
 
 
282 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  36.28 
 
 
263 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
290 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
278 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  41.18 
 
 
282 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.04 
 
 
263 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.04 
 
 
263 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  39.71 
 
 
278 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.38 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  42.42 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
279 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  42.19 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1641  TOBE domain-containing protein  46.03 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000021781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  42.19 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  40.91 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
270 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
279 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
276 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
281 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
281 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
269 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  44.44 
 
 
69 aa  43.9  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  41.27 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  40.91 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.87 
 
 
195 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  42.19 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
278 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.68 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  42.86 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  41.27 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  39.68 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 
262 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.85 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.16 
 
 
380 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  40.62 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
276 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  36.36 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  39.68 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1261  TOBE domain protein  37.88 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880864  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1545  molybdenum-pterin binding protein  37.88 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.206583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3727  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.68 
 
 
367 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  36.23 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  37.5 
 
 
378 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  41.07 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  42.19 
 
 
267 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 
142 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  41.27 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  40.62 
 
 
452 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  30.93 
 
 
269 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2490  molybdenum-pterin binding  39.68 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.17041  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2656  molybdenum-pterin binding  38.1 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00543737  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  35.38 
 
 
268 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  40.32 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  38.1 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  42.19 
 
 
269 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>