More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1729 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  100 
 
 		 434 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  73.29 
 
 		 463 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  71.8 
 
 		 427 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  80.97 
 
 		 432 aa  725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  91.47 
 
 		 434 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  74.42 
 
 		 438 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  72.54 
 
 		 441 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  71.8 
 
 		 427 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  91.47 
 
 		 434 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  76.66 
 
 		 437 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  74.42 
 
 		 437 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  83.68 
 
 		 431 aa  747    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  91.47 
 
 		 434 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  95.39 
 
 		 434 aa  853    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  84.43 
 
 		 440 aa  744    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  68.96 
 
 		 427 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  70.57 
 
 		 428 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  70.1 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  65.78 
 
 		 450 aa  581  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  66.11 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  62.76 
 
 		 436 aa  566  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  62.79 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  63.68 
 
 		 432 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  62.07 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  60.09 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  61.5 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  61.47 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  59.2 
 
 		 425 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  57.78 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  59.28 
 
 		 425 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  56.32 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  58.13 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  55.43 
 
 		 434 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  57.21 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  55.2 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  54.74 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  57.71 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  56.24 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  56.78 
 
 		 439 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  55.07 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  54.5 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  55.27 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  55.06 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  54.82 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  55.9 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  55.16 
 
 		 442 aa  501  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  54.27 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  56.24 
 
 		 430 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  55.06 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  54.8 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  55.17 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  56.01 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  56.52 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  54.13 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  54.92 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  56.65 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  55.27 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  54.48 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  57.35 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  56.52 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  56.52 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  54.93 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  54.91 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  55.29 
 
 		 427 aa  491  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  54.69 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  57 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  56.63 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  56.63 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  54.82 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  53.86 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  54.52 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  55.18 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  55.06 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  54.1 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  55.42 
 
 		 429 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  56.39 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  56.49 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  54.21 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  56.39 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  56.01 
 
 		 428 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  56.39 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  56.25 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  55.42 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  55.4 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  54.12 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  54.1 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  56.14 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  54.12 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  54.59 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  54.52 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  54.12 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  55.85 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  55.04 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  55.77 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  54.16 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  54.46 
 
 		 426 aa  481  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  53.48 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  53.48 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  54.1 
 
 		 438 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1231  type II citrate synthase  54.07 
 
 		 428 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>