More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0068 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  78.39 
 
 
471 aa  697  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  78.39 
 
 
471 aa  696  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  74.73 
 
 
474 aa  638  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
474 aa  951  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  80.21 
 
 
470 aa  720  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  78.39 
 
 
471 aa  697  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  74.03 
 
 
471 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  62.94 
 
 
466 aa  524  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  63.64 
 
 
469 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  61.33 
 
 
457 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  60.18 
 
 
461 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  59.68 
 
 
444 aa  469  1e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  60 
 
 
455 aa  468  1e-130  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  60.14 
 
 
442 aa  468  1e-130  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  59.55 
 
 
457 aa  466  1e-130  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  60.36 
 
 
459 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  59.04 
 
 
434 aa  461  1e-128  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  57.54 
 
 
490 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  58 
 
 
472 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  55.2 
 
 
444 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  54.93 
 
 
441 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  56.98 
 
 
472 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  54.53 
 
 
465 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  54.61 
 
 
441 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  54.99 
 
 
474 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  55.89 
 
 
460 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  53.16 
 
 
450 aa  408  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.42 
 
 
418 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  55.4 
 
 
436 aa  406  1e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  56.16 
 
 
435 aa  400  1e-110  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  54.63 
 
 
423 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  52.42 
 
 
457 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  54.44 
 
 
446 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  54.46 
 
 
442 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  56.67 
 
 
415 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  55.33 
 
 
435 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  54.19 
 
 
416 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  50.9 
 
 
447 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  53.44 
 
 
448 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  51.46 
 
 
426 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  54.07 
 
 
435 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  51.79 
 
 
432 aa  356  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  50.51 
 
 
432 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.62 
 
 
421 aa  297  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  2.64606e-10 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  42.35 
 
 
441 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.12 
 
 
414 aa  285  9e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.12 
 
 
414 aa  285  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  45.77 
 
 
445 aa  284  2e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  43.22 
 
 
415 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  45.8 
 
 
432 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.18 
 
 
440 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.5 
 
 
417 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  44.29 
 
 
461 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.56343e-05  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  46.44 
 
 
432 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  6.98014e-11 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  46.44 
 
 
432 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  46.07 
 
 
444 aa  279  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  47.7 
 
 
384 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.45 
 
 
433 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.77 
 
 
433 aa  275  1e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  42.11 
 
 
426 aa  275  2e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  41.73 
 
 
433 aa  273  4e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  43.01 
 
 
429 aa  273  4e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.21 
 
 
442 aa  273  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  2.30034e-07 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  42.82 
 
 
429 aa  272  8e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  42.78 
 
 
426 aa  272  8e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.78 
 
 
426 aa  272  9e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.97 
 
 
433 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  49.04 
 
 
404 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  7.26108e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  49.04 
 
 
404 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.97 
 
 
433 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.97 
 
 
433 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.74 
 
 
396 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.18 
 
 
434 aa  271  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  49.05 
 
 
414 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.34774e-05 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  49.37 
 
 
395 aa  270  3e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  49.37 
 
 
395 aa  270  3e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  49.37 
 
 
396 aa  271  3e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  49.37 
 
 
396 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  43.83 
 
 
428 aa  270  6e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.46 
 
 
419 aa  270  6e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  41.56 
 
 
426 aa  269  9e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  3.63353e-08 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  43.4 
 
 
439 aa  269  9e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  49.04 
 
 
392 aa  269  9e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.47 
 
 
454 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  49.05 
 
 
396 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  49.04 
 
 
387 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.53 
 
 
436 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  49.04 
 
 
387 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>