More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0055 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  100 
 
 
270 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  100 
 
 
270 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  87.73 
 
 
270 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  100 
 
 
276 aa  399  1e-110  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  67.54 
 
 
268 aa  374  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  67.91 
 
 
268 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  67.41 
 
 
270 aa  355  6e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  63.97 
 
 
254 aa  320  2e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  63.05 
 
 
251 aa  317  9e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  71.43 
 
 
224 aa  308  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  54.04 
 
 
273 aa  283  3e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  54.04 
 
 
273 aa  283  3e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  52.03 
 
 
275 aa  272  5e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  52.77 
 
 
278 aa  271  8e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  50.37 
 
 
274 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  50.93 
 
 
278 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  48 
 
 
293 aa  244  1e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  49.23 
 
 
275 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  44.69 
 
 
276 aa  239  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  48 
 
 
278 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  46.46 
 
 
270 aa  218  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  213  2e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  213  2e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  45.77 
 
 
265 aa  213  3e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  212  4e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  212  4e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  212  4e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  212  4e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  212  4e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  44.32 
 
 
274 aa  212  6e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  43.96 
 
 
274 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  41.73 
 
 
298 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  45.38 
 
 
265 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
280 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  44.36 
 
 
271 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  44.96 
 
 
274 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  45.38 
 
 
270 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  42.49 
 
 
274 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  42.49 
 
 
274 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  42.49 
 
 
274 aa  201  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  42.49 
 
 
274 aa  201  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  42.49 
 
 
274 aa  200  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  42.49 
 
 
274 aa  200  2e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  44.79 
 
 
274 aa  199  4e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  44.53 
 
 
274 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  44.14 
 
 
274 aa  198  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  44.92 
 
 
274 aa  196  4e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  50.97 
 
 
235 aa  195  5e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  41.97 
 
 
280 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  41.76 
 
 
274 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  44.53 
 
 
274 aa  195  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  5.95151e-07  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  42.11 
 
 
285 aa  195  8e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  45.17 
 
 
275 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  44.14 
 
 
274 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  45.71 
 
 
250 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  43.02 
 
 
308 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  43.24 
 
 
295 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  43.24 
 
 
295 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  43.24 
 
 
295 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  42.97 
 
 
274 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  43.75 
 
 
274 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  44.57 
 
 
274 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  39.02 
 
 
294 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 
283 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>