222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2646 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  100 
 
 
647 aa  1333    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.5 
 
 
660 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  38.06 
 
 
674 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.66 
 
 
652 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2849  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.46 
 
 
628 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.96 
 
 
670 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  32.97 
 
 
671 aa  323  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.54 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.93 
 
 
577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  32.58 
 
 
578 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.66 
 
 
577 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.16 
 
 
601 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.5 
 
 
582 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.86 
 
 
597 aa  266  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.6 
 
 
519 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  31.12 
 
 
566 aa  250  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.46 
 
 
594 aa  244  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.58 
 
 
577 aa  240  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.5 
 
 
616 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.72 
 
 
584 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.62 
 
 
564 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.55 
 
 
657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.36 
 
 
628 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  32.75 
 
 
574 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.18 
 
 
587 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  29.95 
 
 
611 aa  230  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.27 
 
 
645 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.02 
 
 
633 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.05 
 
 
527 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  28.83 
 
 
613 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.93 
 
 
645 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  28.87 
 
 
647 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.88 
 
 
534 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.82 
 
 
597 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.55 
 
 
624 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.35 
 
 
585 aa  224  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.6 
 
 
632 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.31 
 
 
515 aa  223  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 
583 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.18 
 
 
582 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.6 
 
 
562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.58 
 
 
589 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.92 
 
 
623 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.87 
 
 
589 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  28.37 
 
 
640 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.62 
 
 
556 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  28.95 
 
 
563 aa  217  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.46 
 
 
564 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.01 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.83 
 
 
524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1497  hydantoinase B/oxoprolinase  28.72 
 
 
659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00877273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.96 
 
 
598 aa  214  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.55 
 
 
558 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 
544 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.76 
 
 
586 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.15 
 
 
579 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.88 
 
 
681 aa  212  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 
528 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.41 
 
 
572 aa  210  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.93 
 
 
599 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.58 
 
 
575 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.96 
 
 
541 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  29.62 
 
 
585 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  28.34 
 
 
600 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  28.42 
 
 
558 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.42 
 
 
558 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4926  Hydantoin utilization protein B  27.03 
 
 
551 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253759  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1520  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.93 
 
 
588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  30.48 
 
 
537 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  28.26 
 
 
581 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.23 
 
 
561 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.72 
 
 
552 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  29.61 
 
 
565 aa  195  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.67 
 
 
557 aa  194  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  28.03 
 
 
1355 aa  194  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  27.15 
 
 
579 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4429  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.32 
 
 
581 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  27.9 
 
 
581 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  27.92 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 
513 aa  189  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.27 
 
 
514 aa  189  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.92 
 
 
634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.94 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.96 
 
 
775 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  28.67 
 
 
577 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.42 
 
 
513 aa  183  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.07 
 
 
514 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.6 
 
 
529 aa  183  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.33 
 
 
521 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.96 
 
 
512 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.01 
 
 
586 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  27.74 
 
 
845 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2528  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.72 
 
 
629 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165308  normal  0.701277 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  26.61 
 
 
1362 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4046  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.8 
 
 
559 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  decreased coverage  0.00136288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  27.95 
 
 
548 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.95 
 
 
1382 aa  177  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.34 
 
 
517 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.31 
 
 
531 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.86 
 
 
651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>