78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1896 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  38.18 
 
 
189 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  43.18 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  40.67 
 
 
220 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  39.73 
 
 
248 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  36.63 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  43.51 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  43.51 
 
 
156 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  44.53 
 
 
157 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  39.16 
 
 
235 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  39.58 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  38.73 
 
 
240 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  41.26 
 
 
219 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  42.34 
 
 
215 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  36.42 
 
 
176 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  34.93 
 
 
371 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  39.86 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  35.37 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  34.76 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  39.69 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  37.69 
 
 
205 aa  84.3  1e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  37.78 
 
 
222 aa  83.6  1e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  37.78 
 
 
222 aa  84  1e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  34.44 
 
 
190 aa  83.6  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  36.89 
 
 
183 aa  82.8  3e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  34.75 
 
 
167 aa  80.1  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  32.08 
 
 
177 aa  78.6  5e-14  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  32.19 
 
 
177 aa  78.2  7e-14  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  37.31 
 
 
159 aa  77.4  1e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  36.05 
 
 
185 aa  77  1e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  38.93 
 
 
171 aa  77  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  36.81 
 
 
165 aa  77.4  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  36.81 
 
 
165 aa  77.4  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  77.4  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  42.22 
 
 
187 aa  76.3  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  37.88 
 
 
187 aa  75.5  4e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  32.9 
 
 
165 aa  75.1  5e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  37.88 
 
 
187 aa  75.5  5e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  29.94 
 
 
177 aa  74.7  7e-13  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  35.21 
 
 
228 aa  73.9  1e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  36.18 
 
 
240 aa  73.6  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  33.12 
 
 
213 aa  70.1  2e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  29.94 
 
 
231 aa  69.7  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  33.67 
 
 
174 aa  67.8  9e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  37.4 
 
 
144 aa  67  1e-10  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  31.47 
 
 
172 aa  64.7  7e-10  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  32.64 
 
 
248 aa  62.8  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  31.05 
 
 
190 aa  62.4  3e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  30.26 
 
 
186 aa  62  4e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  34.93 
 
 
233 aa  62  5e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  33.88 
 
 
194 aa  59.7  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  33.88 
 
 
194 aa  59.3  3e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  33.88 
 
 
194 aa  59.3  3e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  36.08 
 
 
139 aa  59.7  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  33.88 
 
 
194 aa  59.3  3e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  31.34 
 
 
236 aa  57.4  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  30.26 
 
 
216 aa  56.6  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  29.61 
 
 
216 aa  55.5  4e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  26.79 
 
 
196 aa  53.5  2e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  26.79 
 
 
196 aa  53.5  2e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  27.88 
 
 
248 aa  50.1  2e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  33.04 
 
 
612 aa  49.3  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  25.15 
 
 
194 aa  49.3  3e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  29.29 
 
 
198 aa  48.5  6e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  29.09 
 
 
177 aa  47.8  9e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  29.91 
 
 
579 aa  47.8  9e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  25.57 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  25.57 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  31.29 
 
 
646 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  29.2 
 
 
526 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  46.3 
 
 
420 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  29.2 
 
 
526 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  29.2 
 
 
526 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  28.3 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  29.6 
 
 
244 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  28.8 
 
 
649 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  32.07 
 
 
243 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  26.9 
 
 
233 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>