More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1172 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  177  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  84.44 
 
 		 90 aa  154  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  77.78 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  76.67 
 
 		 91 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  75.56 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  74.44 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  73.33 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1701  HU-like DNA-binding protein alpha subunit  76.67 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  65.56 
 
 		 90 aa  123  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  63.33 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  63.33 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  58.89 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 90 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  54.44 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  56.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3710  transcriptional regulator HU subunit alpha  56.18 
 
 		 90 aa  103  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03877  HU, DNA-binding transcriptional regulator, alpha subunit  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.380115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3994  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3864  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5469  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4234  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4491  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0852675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03830  hypothetical protein  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.485291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  55.06 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2303  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0561689  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  55.06 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  53.33 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0222  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3466  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360259  hitchhiker  0.000212777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  52.22 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  53.33 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0226  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0975648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1538  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000676058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43920  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1905  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173408  hitchhiker  0.000216257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4501  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.358882  normal  0.0495174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4577  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511964 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4503  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0164141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4381  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.842423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4414  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.18011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0290  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0031706  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 94 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0354  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.224811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  56.67 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0462  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.082883  hitchhiker  0.00197429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0213  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00855152  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3846  transcriptional regulator HU subunit alpha  53.93 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.219693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  53.93 
 
 		 90 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  54.44 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  54.44 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  54.44 
 
 		 94 aa  99.4  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  56.82 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>