225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1828 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  69.6 
 
 		 250 aa  363  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.63 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  51.61 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  49.19 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 253 aa  242  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.59 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  47.41 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  51.42 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 256 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 254 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 		 254 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 250 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.59 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  48.98 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.18 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  46.75 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  46.8 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  47.98 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  46.96 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  42.57 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  47.97 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  43.6 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>