More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1360 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  76.85 
 
 
432 aa  687    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  100 
 
 
428 aa  874    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  60.98 
 
 
436 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  49.38 
 
 
438 aa  362  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  43.58 
 
 
434 aa  353  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  48.75 
 
 
437 aa  352  7e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  49.38 
 
 
438 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  48.33 
 
 
439 aa  351  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  47.82 
 
 
438 aa  349  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  45.91 
 
 
438 aa  347  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  44.29 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  44.24 
 
 
435 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  48.25 
 
 
439 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  42.53 
 
 
448 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  41.07 
 
 
447 aa  333  4e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  43.35 
 
 
429 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  43.68 
 
 
435 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  42.37 
 
 
435 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  40.36 
 
 
453 aa  302  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  40.41 
 
 
434 aa  299  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  41.47 
 
 
427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  42.06 
 
 
427 aa  289  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  40.81 
 
 
427 aa  285  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  41.23 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  42.38 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  44.24 
 
 
434 aa  282  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  41.51 
 
 
427 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  42.02 
 
 
427 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  42.02 
 
 
427 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  42.02 
 
 
427 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  42.02 
 
 
427 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  41.75 
 
 
427 aa  279  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  40.13 
 
 
462 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  41.47 
 
 
428 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  41.88 
 
 
427 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  41 
 
 
427 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  41.76 
 
 
428 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  38.74 
 
 
465 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  41.61 
 
 
427 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  37.8 
 
 
463 aa  275  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  37.8 
 
 
463 aa  275  9e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  40.81 
 
 
426 aa  275  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  39.23 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  40.43 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  36.72 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  41 
 
 
427 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  37.53 
 
 
469 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  37.74 
 
 
469 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  39.72 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  39.55 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  37.53 
 
 
469 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  39.73 
 
 
428 aa  269  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  40.49 
 
 
471 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  38.72 
 
 
426 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  37.53 
 
 
469 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.6 
 
 
471 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  37.12 
 
 
465 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  37.72 
 
 
474 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  38.81 
 
 
429 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  38.24 
 
 
469 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  40.54 
 
 
426 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  37.31 
 
 
469 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  38.69 
 
 
469 aa  262  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  37.42 
 
 
467 aa  262  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  38.44 
 
 
473 aa  262  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  39.61 
 
 
429 aa  262  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  39.64 
 
 
471 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  37.31 
 
 
469 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  37.88 
 
 
471 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  39.42 
 
 
425 aa  262  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  37.09 
 
 
469 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  38.02 
 
 
469 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  40.05 
 
 
428 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  40.05 
 
 
428 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  40.05 
 
 
428 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  38.77 
 
 
426 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  40.05 
 
 
428 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  40.05 
 
 
428 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  40.35 
 
 
429 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  40.35 
 
 
426 aa  260  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  40.35 
 
 
429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  37.37 
 
 
465 aa  259  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  35.79 
 
 
466 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  36.34 
 
 
422 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  36.17 
 
 
461 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  36.17 
 
 
461 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  42.11 
 
 
433 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  36.85 
 
 
462 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  37.26 
 
 
470 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  41.69 
 
 
428 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  39.63 
 
 
470 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  36.43 
 
 
465 aa  255  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  41.69 
 
 
428 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  41.45 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>