More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1001 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  100 
 
 		 598 aa  1178    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  62.48 
 
 		 600 aa  687    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  51.44 
 
 		 598 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  53.1 
 
 		 601 aa  567  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  50.52 
 
 		 598 aa  525  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  51.39 
 
 		 597 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  47.55 
 
 		 597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  45.04 
 
 		 594 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  46.58 
 
 		 603 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 601 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  46.19 
 
 		 614 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  45.64 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.67 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  46.94 
 
 		 650 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  43.46 
 
 		 596 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  43.32 
 
 		 586 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  43.15 
 
 		 586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.61 
 
 		 580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.38 
 
 		 605 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.97 
 
 		 616 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  44.85 
 
 		 606 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.72 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.52 
 
 		 641 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.31 
 
 		 632 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  44.48 
 
 		 594 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.91 
 
 		 639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.33 
 
 		 629 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.85 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.96 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43 
 
 		 608 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  44.82 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 		 619 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 		 601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3098  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.44 
 
 		 606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  45.36 
 
 		 581 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.64 
 
 		 586 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.69 
 
 		 598 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  42.91 
 
 		 617 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4001  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.62 
 
 		 617 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.530118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.46 
 
 		 600 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  42.78 
 
 		 614 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.76 
 
 		 634 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  42.69 
 
 		 599 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1024  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.37 
 
 		 634 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.13 
 
 		 593 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.44 
 
 		 582 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3087  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.4 
 
 		 620 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2002  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.56 
 
 		 597 aa  439  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.56 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  41.95 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.2 
 
 		 644 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.83 
 
 		 619 aa  435  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3698  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.06 
 
 		 637 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 585 aa  432  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  42.02 
 
 		 597 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.58 
 
 		 590 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3335  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.63 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.509209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.4 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.2 
 
 		 644 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.93 
 
 		 600 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.57 
 
 		 589 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.31 
 
 		 600 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  42.69 
 
 		 681 aa  435  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  43.15 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3665  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  42.68 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.94 
 
 		 614 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  40 
 
 		 579 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  40.24 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.99 
 
 		 586 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  42.24 
 
 		 600 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0882  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.39 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3140  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.56 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  42.68 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.93 
 
 		 585 aa  428  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.47 
 
 		 595 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.93 
 
 		 589 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0969  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.15 
 
 		 613 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  42.1 
 
 		 608 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3232  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.79 
 
 		 618 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.012084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  40.87 
 
 		 648 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  42.37 
 
 		 589 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  40.66 
 
 		 575 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  45.25 
 
 		 578 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.14 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49970  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  46.69 
 
 		 588 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0923957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  41.42 
 
 		 582 aa  425  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.44 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.35 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  44.14 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  44.25 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40 
 
 		 602 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.76 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.57 
 
 		 608 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1985  ABC transporter related  44.1 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.384542  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.41 
 
 		 601 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0852  lipid A ABC exporter family  46.03 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00564413  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  41.44 
 
 		 601 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>