More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1810 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  77.56 
 
 		 202 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  79.7 
 
 		 203 aa  335  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  70.24 
 
 		 202 aa  304  6e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  75.61 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  64.58 
 
 		 268 aa  269  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  64.58 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 267 aa  267  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  65.82 
 
 		 206 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  64.06 
 
 		 214 aa  267  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  63.68 
 
 		 263 aa  264  5.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  62.11 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  58 
 
 		 199 aa  237  6.999999999999999e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  50.26 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  50.79 
 
 		 220 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  50.26 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  49.74 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  48.68 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  53.07 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  53.04 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  49.74 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  47.26 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  47.26 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  45.27 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  45.1 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  40.64 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  40.91 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  43.18 
 
 		 293 aa  158  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  40.44 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  38.02 
 
 		 292 aa  154  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  40 
 
 		 261 aa  144  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.1 
 
 		 290 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  30.99 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  28.64 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  27.36 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  27.36 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  25.81 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  26.89 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  26.89 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  26.72 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  26.42 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  26.42 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  27.43 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  27.04 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  26.89 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  26.79 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  27.15 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  24.79 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  27.47 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  27.36 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  26.97 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  26.55 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  27.49 
 
 		 257 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  25.45 
 
 		 255 aa  71.2  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  26.42 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  26.84 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  27.15 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  26.73 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  27.96 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  26.15 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  25.1 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  25.58 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  25.42 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  28.17 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  24.9 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1954  30S ribosomal protein S2  26.76 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000941341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1672  30S ribosomal protein S2  26.76 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000487185  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3517  ribosomal protein S2  27.44 
 
 		 420 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  26.36 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  26.36 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  23.28 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  26.89 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  25.94 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  26.36 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  26.07 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  27.69 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  24.41 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  24.41 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  25.47 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  27.01 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  26.89 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  26.42 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  25.66 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  24.69 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  26.42 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  26.29 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  25.47 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>