29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0095 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  768    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  24.38 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  23.91 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  22.69 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  22.9 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  27.24 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  22.35 
 
 
629 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  30.94 
 
 
538 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  28.52 
 
 
870 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  25.65 
 
 
368 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.16 
 
 
626 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  22.66 
 
 
840 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.03 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  21.14 
 
 
559 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  21.86 
 
 
553 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  25.23 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  27.82 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  25.4 
 
 
502 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  23.89 
 
 
258 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  24.63 
 
 
391 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  24.54 
 
 
1131 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  24.82 
 
 
417 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  27.85 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.38 
 
 
528 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  22.92 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.59 
 
 
481 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  31.07 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  23.98 
 
 
200 aa  46.2  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.18 
 
 
1287 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>